www.wikidata.uk-ua.nina.az

APOBEC3F англ Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F білок який кодується однойменним геном розташова

APOBEC3F

APOBEC3F (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 45 020.

APOBEC3F
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи APOBEC3F, A3F, ARP8, BK150C2.4.MRNA, KA6, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F
Зовнішні ІД OMIM: 608993 HomoloGene: 105867 GeneCards: APOBEC3F
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
200316
н/д
Ensembl
н/д
UniProt
н/д
RefSeq (мРНК)
н/д
RefSeq (білок)
н/д
Локус (UCSC) Хр. 22: 39.04 – 39.06 Mb н/д
PubMed search н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей
Послідовність амінокислот
1020304050
MKPHFRNTVERMYRDTFSYNFYNRPILSRRNTVWLCYEVKTKGPSRPRLD
AKIFRGQVYSQPEHHAEMCFLSWFCGNQLPAYKCFQITWFVSWTPCPDCV
AKLAEFLAEHPNVTLTISAARLYYYWERDYRRALCRLSQAGARVKIMDDE
EFAYCWENFVYSEGQPFMPWYKFDDNYAFLHRTLKEILRNPMEAMYPHIF
YFHFKNLRKAYGRNESWLCFTMEVVKHHSPVSWKRGVFRNQVDPETHCHA
ERCFLSWFCDDILSPNTNYEVTWYTSWSPCPECAGEVAEFLARHSNVNLT
IFTARLYYFWDTDYQEGLRSLSQEGASVEIMGYKDFKYCWENFVYNDDEP
FKPWKGLKYNFLFLDSKLQEILE

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література ред.

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
  • Wiegand H.L., Doehle B.P., Bogerd H.P., Cullen B.R. (2004). A second human antiretroviral factor, APOBEC3F, is suppressed by the HIV-1 and HIV-2 Vif proteins. EMBO J. 23: 2451—2458. PMID 15152192 DOI:10.1038/sj.emboj.7600246
  • Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains. J. Biol. Chem. 281: 36624—36631. PMID 17020885 DOI:10.1074/jbc.M604980200
  • Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies. PLoS Pathog. 2: E41—E41. PMID 16699599 DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
  • Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350

Примітки ред.

  1. Human PubMed Reference:.
  2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17356 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
APOBEC3F angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi 2 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 373 aminokislot a molekulyarna masa 45 020 3 APOBEC3FNayavni strukturiPDBPoshuk dlya lyudej PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3WUS 4IOU 4J4J 5HX5 5HX4IdentifikatoriSimvoliAPOBEC3F A3F ARP8 BK150C2 4 MRNA KA6 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3FZovnishni ID OMIM 608993 HomoloGene 105867 GeneCards APOBEC3FOntologiya genaMolekulyarna funkciya cytidine deaminase activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist RNA binding hydrolase activity identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma P body apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex klitinne yadro RibonukleoproteyiniBiologichnij proces negative regulation of transposition negative regulation of viral process proces imunnoyi sistemi base conversion or substitution editing negative regulation of viral genome replication defense response to virus DNA cytosine deamination DNA demethylation vrodzhenij imunitet negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate positive regulation of defense response to virus by host cytidine deamination cytidine to uridine editingDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez200316 n dEnsembl ENSG00000128394 n dUniProt Q8IUX4 n dRefSeq mRNK NM 001006666NM 145298n dRefSeq bilok NP 001006667NP 660341n dLokus UCSC Hr 22 39 04 39 06 Mbn dPubMed search 1 n dVikidaniDiv Red dlya lyudej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKPHFRNTVERMYRDTFSYNFYNRPILSRRNTVWLCYEVKTKGPSRPRLD AKIFRGQVYSQPEHHAEMCFLSWFCGNQLPAYKCFQITWFVSWTPCPDCV AKLAEFLAEHPNVTLTISAARLYYYWERDYRRALCRLSQAGARVKIMDDE EFAYCWENFVYSEGQPFMPWYKFDDNYAFLHRTLKEILRNPMEAMYPHIF YFHFKNLRKAYGRNESWLCFTMEVVKHHSPVSWKRGVFRNQVDPETHCHA ERCFLSWFCDDILSPNTNYEVTWYTSWSPCPECAGEVAEFLARHSNVNLT IFTARLYYFWDTDYQEGLRSLSQEGASVEIMGYKDFKYCWENFVYNDDEP FKPWKGLKYNFLFLDSKLQEILE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet antivirusnij zahist Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi Literatura red The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Wedekind J E Dance G S C Sowden M P Smith H C 2003 Messenger RNA editing in mammals new members of the APOBEC family seeking roles in the family business Trends Genet 19 207 216 PMID 12683974 DOI 10 1016 S0168 9525 03 00054 4 Wiegand H L Doehle B P Bogerd H P Cullen B R 2004 A second human antiretroviral factor APOBEC3F is suppressed by the HIV 1 and HIV 2 Vif proteins EMBO J 23 2451 2458 PMID 15152192 DOI 10 1038 sj emboj 7600246 Hakata Y Landau N R 2006 Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains J Biol Chem 281 36624 36631 PMID 17020885 DOI 10 1074 jbc M604980200 Wichroski M J Robb G B Rana T M 2006 Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies PLoS Pathog 2 E41 E41 PMID 16699599 DOI 10 1371 journal ppat 0020041 Chiu Y L Greene W C 2008 The APOBEC3 cytidine deaminases an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements Annu Rev Immunol 26 317 353 PMID 18304004 DOI 10 1146 annurev immunol 26 021607 090350Primitki red Human PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17356 angl Procitovano 22 serpnya 2017 UniProt Q8IUX4 angl Arhiv originalu za 2 bereznya 2018 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozh red Hromosoma 22 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title APOBEC3F amp oldid 38955476