www.wikidata.uk-ua.nina.az

VAPB англ VAMP associated protein B and C білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

VAPB

VAPB (англ. VAMP associated protein B and C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 27 228.

VAPB
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи VAPB, ALS8, VAMP-B, VAP-B, VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein B and C, VAMP associated protein B and C
Зовнішні ІД OMIM: 605704 MGI: 1928744 HomoloGene: 36163 GeneCards: VAPB
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic lateral sclerosis type 8
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9217
56491
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 20: 58.39 – 58.45 Mb Хр. 2: 173.58 – 173.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAKVEQVLSLEPQHELKFRGPFTDVVTTNLKLGNPTDRNVCFKVKTTAPR
RYCVRPNSGIIDAGASINVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQSMFAPTDTS
DMEAVWKEAKPEDLMDSKLRCVFELPAENDKPHDVEINKIISTTASKTET
PIVSKSLSSSLDDTEVKKVMEECKRLQGEVQRLREENKQFKEEDGLRMRK
TVQSNSPISALAPTGKEEGLSTRLLALVVLFFIVGVIIGKIAL

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література ред.

  • Nishimura Y., Hayashi M., Inada H., Tanaka T. (1999). Molecular cloning and characterization of mammalian homologues of vesicle-associated membrane protein-associated (VAMP-associated) proteins.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 254: 21 — 26.  PubMed DOI:10.1006/bbrc.1998.9876
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kanekura K., Nishimoto I., Aiso S., Matsuoka M. (2006). Characterization of amyotrophic lateral sclerosis-linked P56S mutation of vesicle-associated membrane protein-associated protein B (VAPB/ALS8).. J. Biol. Chem. 281: 30223 — 30233.  PubMed DOI:10.1074/jbc.M605049200
  • Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein.. J. Biol. Chem. 284: 13766 — 13777.  PubMed DOI:10.1074/jbc.M807938200
  • Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation.. Mol. Biol. Cell. 22: 4602 — 4620.  PubMed DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437.  PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки ред.

  1. Захворювання, генетично пов'язані з VAPB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 21 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
VAPB angl VAMP associated protein B and C bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 243 aminokislot a molekulyarna masa 27 228 5 VAPBNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB2MDK 3IKKIdentifikatoriSimvoliVAPB ALS8 VAMP B VAP B VAMP vesicle associated membrane protein associated protein B and C VAMP associated protein B and CZovnishni ID OMIM 605704 MGI 1928744 HomoloGene 36163 GeneCards VAPBPov yazani genetichni zahvoryuvannyaamyotrophic lateral sclerosis type 8 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity microtubule binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding beta tubulin binding protein heterodimerization activity enzyme binding cadherin binding FFAT motif bindingKlitinna komponenta integral component of membrane kompleks Goldzhi endoplasmic reticulum membrane membrana endoplazmatichnij retikulum endoplasmic reticulum exit site Golgi membrane citoplazmaBiologichnij proces COPII coated vesicle budding cellular calcium ion homeostasis sphingolipid biosynthetic process endoplasmic reticulum organization positive regulation by host of viral genome replication Vidpovid na nezgornuti bilki endoplasmic reticulum to Golgi vesicle mediated transport response to unfolded protein suppression of viral release by host negative regulation by host of viral genome replication positive regulation of viral genome replication negative regulation by virus of viral protein levels in host cell GO 0022415 viral process modulation by host of viral RNA genome replication IRE1 mediated unfolded protein responseDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9217 56491Ensembl ENSG00000124164 ENSMUSG00000054455UniProt O95292 Q9QY76Q8BH80RefSeq mRNK NM 001195677NM 004738NM 019806RefSeq bilok NP 001182606NP 004729NP 062780Lokus UCSC Hr 20 58 39 58 45 MbHr 2 173 58 173 63 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MAKVEQVLSLEPQHELKFRGPFTDVVTTNLKLGNPTDRNVCFKVKTTAPRRYCVRPNSGIIDAGASINVSVMLQPFDYDPNEKSKHKFMVQSMFAPTDTSDMEAVWKEAKPEDLMDSKLRCVFELPAENDKPHDVEINKIISTTASKTETPIVSKSLSSSLDDTEVKKVMEECKRLQGEVQRLREENKQFKEEDGLRMRKTVQSNSPISALAPTGKEEGLSTRLLALVVLFFIVGVIIGKIALA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus vidpovid na porushennya konformaciyi bilku acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u membrani endoplazmatichnomu retikulumi Literatura red Nishimura Y Hayashi M Inada H Tanaka T 1999 Molecular cloning and characterization of mammalian homologues of vesicle associated membrane protein associated VAMP associated proteins Biochem Biophys Res Commun 254 21 26 PubMed DOI 10 1006 bbrc 1998 9876 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Kanekura K Nishimoto I Aiso S Matsuoka M 2006 Characterization of amyotrophic lateral sclerosis linked P56S mutation of vesicle associated membrane protein associated protein B VAPB ALS8 J Biol Chem 281 30223 30233 PubMed DOI 10 1074 jbc M605049200 Saita S Shirane M Natume T Iemura S Nakayama K I 2009 Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle associated membrane protein associated protein J Biol Chem 284 13766 13777 PubMed DOI 10 1074 jbc M807938200 Matsuzaki F Shirane M Matsumoto M Nakayama K I 2011 Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation Mol Biol Cell 22 4602 4620 PubMed DOI 10 1091 mbc E11 01 0068 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PubMed DOI 10 1073 pnas 1413825111Primitki red Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z VAPB pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 12649 angl Arhiv originalu za 21 zhovtnya 2018 Procitovano 12 veresnya 2017 UniProt O95292 angl Arhiv originalu za 9 kvitnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozh red Hromosoma 20 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title VAPB amp oldid 35762210