Альтернативний сплайсинг механізм виникнення варіацій при сплайсингу РНК за рахунок відокремлення екзонів попередника мР

Альтернативний сплайсинг — механізм виникнення варіацій при сплайсингу РНК за рахунок відокремлення екзонів попередника мРНК (пре-мРНК) і їх повторного з'єднання. В результаті отримуються альтернативні варіанти нуклеотидної послідовності мРНК. Ці варіанти мРНК, мРНК-ізоформи. або сплайс-варіанти, потім зазвичай використовуються у процесі трансляції та переводяться в амінокислотну послідовність, формуючи ізоформи білків. Таким чином, альтернативний сплайсинг збільшує різноманітність білків, що синтезуються клітиною.

Методи альтернативного сплайсингу

Альтернативний сплайсинг вважається основним процесом, що призводить до різноманіття білків (поряд з обмеженим протеолізом, редагуванням мРНК тощо), яке значно перевищує кількість генів у геномах організмах. Так, наприклад, у геномі людини знаходиться менше 19 тисяч функціональних генів. Водночас кількість відомих білків людини, за базою даних UniProt, перевищує 154 тисячі станом на липень 2016 року.

Історія дослідження Редагувати

Альтернативний сплайсинг було вперше описано 1977 року в аденовірусів. У 1981 році подібний механізм було виявлено при синтезі гормону ссавців кальцитоніну. Цього ж року було доведено, що мРНК антитіл також підлягають альтернативному сплайсингу. Надалі таких білків було виявлено тисячі.

Найбільше сплайс-ізоформ, які утворюються з однієї пре-мРНК, відомо для гена DSCAM з нервової системи дрозофіли: 2000 року в нього було описано більше 38 тисяч варіантів.

Примітки Редагувати

Xiang-Dong Fu & Manuel Jr Ares (August 2014). Context-dependent control of alternative splicing by RNA-binding proteins. Nature reviews. Genetics. PMID 25112293. doi:10.1038/nrg3778.
Ezkurdia, I.; Juan, D.; Rodriguez, J. M.; Frankish, A.; Diekhans, M.; Harrow, J.; Vazquez, J.; Valencia, A. та ін. (2014). Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19 000 human protein-coding genes. Human Molecular Genetics 23 (22): 5866–5878. ISSN 0964-6906. doi:10.1093/hmg/ddu309.
UniProtKB results: Homo sapiens [ 18 серпня 2016 у Wayback Machine.](англ.)
Schmucker, Dietmar; Clemens, James C; Shu, Huidy; Worby, Carolyn A; Xiao, Jian; Muda, Marco; Dixon, Jack E; Zipursky, S.Lawrence (2000). Drosophila Dscam Is an Axon Guidance Receptor Exhibiting Extraordinary Molecular Diversity. Cell 101 (6): 671–684. ISSN 00928674. doi:10.1016/S0092-8674(00)80878-8.

Це незавершена стаття з молекулярної біології.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[Control_altSpl-1] Xiang-Dong Fu & Manuel Jr Ares (August 2014). Context-dependent control of alternative splicing by RNA-binding proteins. Nature reviews. Genetics. PMID 25112293. doi:10.1038/nrg3778.

[EzkurdiaJuan2014-2] Ezkurdia, I.; Juan, D.; Rodriguez, J. M.; Frankish, A.; Diekhans, M.; Harrow, J.; Vazquez, J.; Valencia, A. та ін. (2014). Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19 000 human protein-coding genes. Human Molecular Genetics 23 (22): 5866–5878. ISSN 0964-6906. doi:10.1093/hmg/ddu309.

[3] UniProtKB results: Homo sapiens [ 18 серпня 2016 у Wayback Machine.](англ.)

[SchmuckerClemens2000-4] Schmucker, Dietmar; Clemens, James C; Shu, Huidy; Worby, Carolyn A; Xiao, Jian; Muda, Marco; Dixon, Jack E; Zipursky, S.Lawrence (2000). Drosophila Dscam Is an Axon Guidance Receptor Exhibiting Extraordinary Molecular Diversity. Cell 101 (6): 671–684. ISSN 00928674. doi:10.1016/S0092-8674(00)80878-8.