www.wikidata.uk-ua.nina.az

NXF1 англ Nuclear RNA export factor 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 11

NXF1

NXF1 (англ. Nuclear RNA export factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 70 182.

NXF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NXF1, MEX67, TAP, nuclear RNA export factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 602647 MGI: 1858330 HomoloGene: 38176 GeneCards: NXF1
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10482
53319
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 11: 62.79 – 62.81 Mb Хр. 19: 8.73 – 8.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGIRSS
RLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDR
APPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPI
EFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTI
LNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRR
SCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIVQKAPNLKILNLSG
NELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLR
LDGHELPPPIAFDVEAPTTLPPCKGSYFGTENLKSLVLHFLQQYYAIYDS
GDRQGLLDAYHDGACCSLSIPFIPQNPARSSLAEYFKDSRNVKKLKDPTL
RFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDVNSFVVDISAQTSTLLCFSVNGVFK
EVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASSEEIQRAFAM
PAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNNWDYTRSA
QAFTHLKAKGEIPEVAFMK

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література Редагувати

  • Braun I.C., Rohrbach E., Schmitt C., Izaurralde E. (1999). TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus.. EMBO J. 18: 1953 — 1965.  PubMed DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
  • Kang Y., Cullen B.R. (1999). The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA-binding and nucleocytoplasmic transport sequences.. Genes Dev. 13: 1126 — 1139.  PubMed DOI:10.1101/gad.13.9.1126
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Braun I.C., Herold A., Rode M., Conti E., Izaurralde E. (2001). Overexpression of TAP/p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export.. J. Biol. Chem. 276: 20536 — 20543.  PubMed DOI:10.1074/jbc.M100400200
  • Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex.. EMBO J. 20: 6424 — 6433.  PubMed DOI:10.1093/emboj/20.22.6424
  • Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex.. Science 293: 1832 — 1836.  PubMed DOI:10.1126/science.1062829

Примітки Редагувати

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8071 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. 

Див. також Редагувати

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
NXF1 angl Nuclear RNA export factor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi 3 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 619 aminokislot a molekulyarna masa 70 182 4 NXF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4WYK 1FO1 1FT8 1GO5 1JKG 1JN5 1KOH 1KOO 1OAI 2Z5K 2Z5M 3RW6 3RW7IdentifikatoriSimvoliNXF1 MEX67 TAP nuclear RNA export factor 1Zovnishni ID OMIM 602647 MGI 1858330 HomoloGene 38176 GeneCards NXF1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding mRNA binding GO 0005487 structural constituent of nuclear pore nucleic acid binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma nuclear speck transcription export complex Yaderna pora vnutrishnoklitinnij nuclear inclusion body klitinne yadro Nukleoplazma nuclear envelopeBiologichnij proces mRNA transport mRNA export from nucleus poly A mRNA export from nucleus GO 0022415 viral process RNA export from nucleus GO 0015915 transport protein transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10482 53319Ensembl ENSG00000162231 ENSMUSG00000010097UniProt Q9UBU9 Q99JX7RefSeq mRNK NM 006362NM 001081491NM 001276704NM 016813RefSeq bilok NP 001074960NP 006353NP 001263633NP 058093Lokus UCSC Hr 11 62 79 62 81 MbHr 19 8 73 8 75 MbPubMed search 1 2 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGIRSSRLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTILNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTTLPPCKGSYFGTENLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPFIPQNPARSSLAEYFKDSRNVKKLKDPTLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDVNSFVVDISAQTSTLLCFSVNGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASSEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNNWDYTRSAQAFTHLKAKGEIPEVAFMKA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus transport transport mRNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri Literatura RedaguvatiBraun I C Rohrbach E Schmitt C Izaurralde E 1999 TAP binds to the constitutive transport element CTE through a novel RNA binding motif that is sufficient to promote CTE dependent RNA export from the nucleus EMBO J 18 1953 1965 PubMed DOI 10 1093 emboj 18 7 1953 Kang Y Cullen B R 1999 The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA binding and nucleocytoplasmic transport sequences Genes Dev 13 1126 1139 PubMed DOI 10 1101 gad 13 9 1126 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Braun I C Herold A Rode M Conti E Izaurralde E 2001 Overexpression of TAP p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export J Biol Chem 276 20536 20543 PubMed DOI 10 1074 jbc M100400200 Kataoka N Diem M D Kim V N Yong J Dreyfuss G 2001 Magoh a human homolog of Drosophila mago nashi protein is a component of the splicing dependent exon exon junction complex EMBO J 20 6424 6433 PubMed DOI 10 1093 emboj 20 22 6424 Kim V N Kataoka N Dreyfuss G 2001 Role of the nonsense mediated decay factor hUpf3 in the splicing dependent exon exon junction complex Science 293 1832 1836 PubMed DOI 10 1126 science 1062829Primitki Redaguvati Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8071 angl Procitovano 8 veresnya 2017 UniProt Q9UBU9 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozh RedaguvatiHromosoma 11 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title NXF1 amp oldid 35681251