www.wikidata.uk-ua.nina.az

DDX6 англ DEAD box helicase 6 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 11 ї хромос

DDX6

DDX6 (англ. DEAD-box helicase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 54 417.

DDX6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DDX6, HLR2, P54, RCK, DEAD-box helicase 6, IDDILF, Rck/p54
Зовнішні ІД OMIM: 600326 MGI: 104976 HomoloGene: 3238 GeneCards: DDX6
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1656
13209
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 11: 118.75 – 118.79 Mb Хр. 9: 44.52 – 44.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPTGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNT
INNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFED
YCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAY
LIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATT
GGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADK
LLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINL
MEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELL
AKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDI
QAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIE
EQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література ред.

  • Lu D., Yunis J.J. (1992). Cloning, expression and localization of an RNA helicase gene from a human lymphoid cell line with chromosomal breakpoint 11q23.3.. Nucleic Acids Res. 20: 1967 — 1972.  PubMed DOI:10.1093/nar/20.8.1967
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping.. Mol. Cell 20: 905 — 915.  PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
  • Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies.. PLoS Pathog. 2: E41 — E41.  PubMed DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
  • Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies.. J. Virol. 86: 11712 — 11724.  PubMed DOI:10.1128/JVI.00595-12

Примітки ред.

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. (англ.). Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
DDX6 angl DEAD box helicase 6 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi 3 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 483 aminokislot a molekulyarna masa 54 417 4 DDX6Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1VEC 2WAX 2WAY 4CRW 4CT4 4CT5 5ANRIdentifikatoriSimvoliDDX6 HLR2 P54 RCK DEAD box helicase 6 IDDILF Rck p54Zovnishni ID OMIM 600326 MGI 104976 HomoloGene 3238 GeneCards DDX6Ontologiya genaMolekulyarna funkciya RNA helicase activity nucleotide binding GO 0008026 helicase activity protein domain specific binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding hydrolase activity ATP binding RNA binding cadherin bindingKlitinna komponenta citoplazma RISC membrana P body cytoplasmic stress granule mitohondriya sperm annulus P granule outer dense fiber GO 0035328 Geterohromatin klitinne yadro gialoplazma Yaderce cytoplasmic ribonucleoprotein granule chromatoid body perinuclear region of cytoplasm concave side of sperm headBiologichnij proces negative regulation of neuron differentiation stem cell population maintenance RNA secondary structure unwinding P body assembly exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA viral RNA genome packaging regulation of translation Spermatogenez spermatid differentiationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1656 13209Ensembl ENSG00000110367 ENSMUSG00000032097UniProt P26196 P54823RefSeq mRNK NM 001257191NM 004397NM 001110826NM 007841NM 181324NM 001357702NM 001357703RefSeq bilok NP 001244120NP 004388NP 001104296NP 031867NP 851841NP 001344631NP 001344632Lokus UCSC Hr 11 118 75 118 79 MbHr 9 44 52 44 55 MbPubMed search 1 2 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPTGGPGGGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEELTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKPA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri Literatura red Lu D Yunis J J 1992 Cloning expression and localization of an RNA helicase gene from a human lymphoid cell line with chromosomal breakpoint 11q23 3 Nucleic Acids Res 20 1967 1972 PubMed DOI 10 1093 nar 20 8 1967 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Fenger Groen M Fillman C Norrild B Lykke Andersen J 2005 Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping Mol Cell 20 905 915 PubMed DOI 10 1016 j molcel 2005 10 031 Wichroski M J Robb G B Rana T M 2006 Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies PLoS Pathog 2 E41 E41 PubMed DOI 10 1371 journal ppat 0020041 Phalora P K Sherer N M Wolinsky S M Swanson C M Malim M H 2012 HIV 1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies J Virol 86 11712 11724 PubMed DOI 10 1128 JVI 00595 12Primitki red Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2747 angl Arhiv originalu za 6 lipnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 UniProt P26196 angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 Div takozh red Hromosoma 11 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title DDX6 amp oldid 35596604