www.wikidata.uk-ua.nina.az

VCAN англ Versican білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 5 ї хромосоми 4 Довжин

VCAN

VCAN (англ. Versican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 396 амінокислот, а молекулярна маса — 372 820.

VCAN
Ідентифікатори
Символи VCAN, CSPG2, ERVR, GHAP, PG-M, WGN, WGN1, versican
Зовнішні ІД OMIM: 118661 MGI: 102889 HomoloGene: 3228 GeneCards: VCAN
Пов'язані генетичні захворювання
Wagner's disease
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1462
13003
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
н/д
Локус (UCSC) Хр. 5: 83.47 – 83.58 Mb Хр. 13: 89.8 – 89.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MFINIKSILWMCSTLIVTHALHKVKVGKSPPVRGSLSGKVSLPCHFSTMP
TLPPSYNTSEFLRIKWSKIEVDKNGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQDYKGR
VSVPTHPEAVGDASLTVVKLLASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLTVDGV
VFHYRAATSRYTLNFEAAQKACLDVGAVIATPEQLFAAYEDGFEQCDAGW
LADQTVRYPIRAPRVGCYGDKMGKAGVRTYGFRSPQETYDVYCYVDHLDG
DVFHLTVPSKFTFEEAAKECENQDARLATVGELQAAWRNGFDQCDYGWLS
DASVRHPVTVARAQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPPPDSRFDAYCFKPKE
ATTIDLSILAETASPSLSKEPQMVSDRTTPIIPLVDELPVIPTEFPPVGN
IVSFEQKATVQPQAITDSLATKLPTPTGSTKKPWDMDDYSPSASGPLGKL
DISEIKEEVLQSTTGVSHYATDSWDGVVEDKQTQESVTQIEQIEVGPLVT
SMEILKHIPSKEFPVTETPLVTARMILESKTEKKMVSTVSELVTTGHYGF
TLGEEDDEDRTLTVGSDESTLIFDQIPEVITVSKTSEDTIHTHLEDLESV
SASTTVSPLIMPDNNGSSMDDWEERQTSGRITEEFLGKYLSTTPFPSQHR
TEIELFPYSGDKILVEGISTVIYPSLQTEMTHRRERTETLIPEMRTDTYT
DEIQEEITKSPFMGKTEEEVFSGMKLSTSLSEPIHVTESSVEMTKSFDFP
TLITKLSAEPTEVRDMEEDFTATPGTTKYDENITTVLLAHGTLSVEAATV
SKWSWDEDNTTSKPLESTEPSASSKLPPALLTTVGMNGKDKDIPSFTEDG
ADEFTLIPDSTQKQLEEVTDEDIAAHGKFTIRFQPTTSTGIAEKSTLRDS
TTEEKVPPITSTEGQVYATMEGSALGEVEDVDLSKPVSTVPQFAHTSEVE
GLAFVSYSSTQEPTTYVDSSHTIPLSVIPKTDWGVLVPSVPSEDEVLGEP
SQDILVIDQTRLEATISPETMRTTKITEGTTQEEFPWKEQTAEKPVPALS
STAWTPKEAVTPLDEQEGDGSAYTVSEDELLTGSERVPVLETTPVGKIDH
SVSYPPGAVTEHKVKTDEVVTLTPRIGPKVSLSPGPEQKYETEGSSTTGF
TSSLSPFSTHITQLMEETTTEKTSLEDIDLGSGLFEKPKATELIEFSTIK
VTVPSDITTAFSSVDRLHTTSAFKPSSAITKKPPLIDREPGEETTSDMVI
IGESTSHVPPTTLEDIVAKETETDIDREYFTTSSPPATQPTRPPTVEDKE
AFGPQALSTPQPPASTKFHPDINVYIIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSE
SKEDEPCSEETDPVHDLMAEILPEFPDIIEIDLYHSEENEEEEEECANAT
DVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDPEAAEARRGQFESVAPSQNFSDSSESD
THPFVIAKTELSTAVQPNESTETTESLEVTWKPETYPETSEHFSGGEPDV
FPTVPFHEEFESGTAKKGAESVTERDTEVGHQAHEHTEPVSLFPEESSGE
IAIDQESQKIAFARATEVTFGEEVEKSTSVTYTPTIVPSSASAYVSEEEA
VTLIGNPWPDDLLSTKESWVEATPRQVVELSGSSSIPITEGSGEAEEDED
TMFTMVTDLSQRNTTDTLITLDTSRIITESFFEVPATTIYPVSEQPSAKV
VPTKFVSETDTSEWISSTTVEEKKRKEEEGTTGTASTFEVYSSTQRSDQL
ILPFELESPNVATSSDSGTRKSFMSLTTPTQSEREMTDSTPVFTETNTLE
NLGAQTTEHSSIHQPGVQEGLTTLPRSPASVFMEQGSGEAAADPETTTVS
SFSLNVEYAIQAEKEVAGTLSPHVETTFSTEPTGLVLSTVMDRVVAENIT
QTSREIVISERLGEPNYGAEIRGFSTGFPLEEDFSGDFREYSTVSHPIAK
EETVMMEGSGDAAFRDTQTSPSTVPTSVHISHISDSEGPSSTMVSTSAFP
WEEFTSSAEGSGEQLVTVSSSVVPVLPSAVQKFSGTASSIIDEGLGEVGT
VNEIDRRSTILPTAEVEGTKAPVEKEEVKVSGTVSTNFPQTIEPAKLWSR
QEVNPVRQEIESETTSEEQIQEEKSFESPQNSPATEQTIFDSQTFTETEL
KTTDYSVLTTKKTYSDDKEMKEEDTSLVNMSTPDPDANGLESYTTLPEAT
EKSHFFLATALVTESIPAEHVVTDSPIKKEESTKHFPKGMRPTIQESDTE
LLFSGLGSGEEVLPTLPTESVNFTEVEQINNTLYPHTSQVESTSSDKIED
FNRMENVAKEVGPLVSQTDIFEGSGSVTSTTLIEILSDTGAEGPTVAPLP
FSTDIGHPQNQTVRWAEEIQTSRPQTITEQDSNKNSSTAEINETTTSSTD
FLARAYGFEMAKEFVTSAPKPSDLYYEPSGEGSGEVDIVDSFHTSATTQA
TRQESSTTFVSDGSLEKHPEVPSAKAVTADGFPTVSVMLPLHSEQNKSSP
DPTSTLSNTVSYERSTDGSFQDRFREFEDSTLKPNRKKPTENIIIDLDKE
DKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDIDHTKPVYEDILGMQTDIDTE
VPSEPHDSNDESNDDSTQVQEIYEAAVNLSLTEETFEGSADVLASYTQAT
HDESMTYEDRSQLDHMGFHFTTGIPAPSTETELDVLLPTATSLPIPRKSA
TVIPEIEGIKAEAKALDDMFESSTLSDGQAIADQSEIIPTLGQFERTQEE
YEDKKHAGPSFQPEFSSGAEEALVDHTPYLSIATTHLMDQSVTEVPDVME
GSNPPYYTDTTLAVSTFAKLSSQTPSSPLTIYSGSEASGHTEIPQPSALP
GIDVGSSVMSPQDSFKEIHVNIEATFKPSSEEYLHITEPPSLSPDTKLEP
SEDDGKPELLEEMEASPTELIAVEGTEILQDFQNKTDGQVSGEAIKMFPT
IKTPEAGTVITTADEIELEGATQWPHSTSASATYGVEAGVVPWLSPQTSE
RPTLSSSPEINPETQAALIRGQDSTIAASEQQVAARILDSNDQATVNPVE
FNTEVATPPFSLLETSNETDFLIGINEESVEGTAIYLPGPDRCKMNPCLN
GGTCYPTETSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGFNTFR
CLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQ
GAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENW
RPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPP
VVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAIPKI
TCMNPSAYQRTYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHRWSRRWQESRR

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література ред.

  • Zako M., Shinomura T., Ujita M., Ito K., Kimata K. (1995). Expression of PG-M(V3), an alternatively spliced form of PG-M without a chondroitin sulfate attachment in region in mouse and human tissues.. J. Biol. Chem. 270: 3914 — 3918.  PubMed DOI:10.1074/jbc.270.8.3914
  • Yao L.Y., Moody C., Schoenherr E., Wight T.N., Sandell L.J. (1994). Identification of the proteoglycan versican in aorta and smooth muscle cells by DNA sequence analysis, in situ hybridization and immunohistochemistry.. Matrix Biol. 14: 213 — 225.  PubMed DOI:10.1016/0945-053X(94)90185-6
  • Iozzo R.V., Naso M.F., Cannizzaro L.A., Wasmuth J.J., McPherson J.D. (1992). Mapping of the versican proteoglycan gene (CSPG2) to the long arm of human chromosome 5 (5q12-5q14).. Genomics 14: 845 — 851.  PubMed DOI:10.1016/S0888-7543(05)80103-X
  • Bignami A., Lane W.S., Andrews D., Dahl D. (1989). Structural similarity of hyaluronate binding proteins in brain and cartilage.. Brain Res. Bull. 22: 67 — 70.  PubMed DOI:10.1016/0361-9230(89)90129-9
  • Zimmermann D.R., Ruoslahti E. (1989). Multiple domains of the large fibroblast proteoglycan, versican.. EMBO J. 8: 2975 — 2981.  PubMed
  • Dours-Zimmermann M.T., Zimmermann D.R. (1994). A novel glycosaminoglycan attachment domain identified in two alternative splice variants of human versican.. J. Biol. Chem. 269: 32992 — 32998.  PubMed

Примітки ред.

  1. Захворювання, генетично пов'язані з VCAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
VCAN angl Versican bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 3 396 aminokislot a molekulyarna masa 372 820 5 VCANIdentifikatoriSimvoliVCAN CSPG2 ERVR GHAP PG M WGN WGN1 versicanZovnishni ID OMIM 118661 MGI 102889 HomoloGene 3228 GeneCards VCANPov yazani genetichni zahvoryuvannyaWagner s disease 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding glycosaminoglycan binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding carbohydrate binding extracellular matrix structural constituent hyaluronic acid binding extracellular matrix structural constituent conferring compression resistanceKlitinna komponenta membrana GO 0005578 Pozaklitinna matricya lysosomal lumen Golgi lumen extracellular space endoplasmic reticulum lumen extracellular region collagen containing extracellular matrix vnutrishnoklitinna membranna organelaBiologichnij proces glycosaminoglycan metabolic process skeletal system development cell recognition chondroitin sulfate biosynthetic process extracellular matrix organization multicellular organism development central nervous system development adgeziya klitin osteoblast differentiation chondroitin sulfate catabolic process dermatan sulfate biosynthetic process glial cell migration posttranslyacijna modifikaciyaDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1462 13003Ensembl ENSG00000038427 ENSMUSG00000021614UniProt P13611Q86W61 Q62059RefSeq mRNK NM 004385NM 001126336NM 001164097NM 001164098NM 001081249NM 001134474NM 001134475NM 019389NM 172955RefSeq bilok NP 001119808NP 001157569NP 001157570NP 004376NP 001119808 1n dLokus UCSC Hr 5 83 47 83 58 MbHr 13 89 8 89 89 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MFINIKSILWMCSTLIVTHALHKVKVGKSPPVRGSLSGKVSLPCHFSTMPTLPPSYNTSEFLRIKWSKIEVDKNGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQDYKGRVSVPTHPEAVGDASLTVVKLLASDAGLYRCDVMYGIEDTQDTVSLTVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAQKACLDVGAVIATPEQLFAAYEDGFEQCDAGWLADQTVRYPIRAPRVGCYGDKMGKAGVRTYGFRSPQETYDVYCYVDHLDGDVFHLTVPSKFTFEEAAKECENQDARLATVGELQAAWRNGFDQCDYGWLSDASVRHPVTVARAQCGGGLLGVRTLYRFENQTGFPPPDSRFDAYCFKPKEATTIDLSILAETASPSLSKEPQMVSDRTTPIIPLVDELPVIPTEFPPVGNIVSFEQKATVQPQAITDSLATKLPTPTGSTKKPWDMDDYSPSASGPLGKLDISEIKEEVLQSTTGVSHYATDSWDGVVEDKQTQESVTQIEQIEVGPLVTSMEILKHIPSKEFPVTETPLVTARMILESKTEKKMVSTVSELVTTGHYGFTLGEEDDEDRTLTVGSDESTLIFDQIPEVITVSKTSEDTIHTHLEDLESVSASTTVSPLIMPDNNGSSMDDWEERQTSGRITEEFLGKYLSTTPFPSQHRTEIELFPYSGDKILVEGISTVIYPSLQTEMTHRRERTETLIPEMRTDTYTDEIQEEITKSPFMGKTEEEVFSGMKLSTSLSEPIHVTESSVEMTKSFDFPTLITKLSAEPTEVRDMEEDFTATPGTTKYDENITTVLLAHGTLSVEAATVSKWSWDEDNTTSKPLESTEPSASSKLPPALLTTVGMNGKDKDIPSFTEDGADEFTLIPDSTQKQLEEVTDEDIAAHGKFTIRFQPTTSTGIAEKSTLRDSTTEEKVPPITSTEGQVYATMEGSALGEVEDVDLSKPVSTVPQFAHTSEVEGLAFVSYSSTQEPTTYVDSSHTIPLSVIPKTDWGVLVPSVPSEDEVLGEPSQDILVIDQTRLEATISPETMRTTKITEGTTQEEFPWKEQTAEKPVPALSSTAWTPKEAVTPLDEQEGDGSAYTVSEDELLTGSERVPVLETTPVGKIDHSVSYPPGAVTEHKVKTDEVVTLTPRIGPKVSLSPGPEQKYETEGSSTTGFTSSLSPFSTHITQLMEETTTEKTSLEDIDLGSGLFEKPKATELIEFSTIKVTVPSDITTAFSSVDRLHTTSAFKPSSAITKKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSHVPPTTLEDIVAKETETDIDREYFTTSSPPATQPTRPPTVEDKEAFGPQALSTPQPPASTKFHPDINVYIIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSESKEDEPCSEETDPVHDLMAEILPEFPDIIEIDLYHSEENEEEEEECANATDVTTTPSVQYINGKHLVTTVPKDPEAAEARRGQFESVAPSQNFSDSSESDTHPFVIAKTELSTAVQPNESTETTESLEVTWKPETYPETSEHFSGGEPDVFPTVPFHEEFESGTAKKGAESVTERDTEVGHQAHEHTEPVSLFPEESSGEIAIDQESQKIAFARATEVTFGEEVEKSTSVTYTPTIVPSSASAYVSEEEAVTLIGNPWPDDLLSTKESWVEATPRQVVELSGSSSIPITEGSGEAEEDEDTMFTMVTDLSQRNTTDTLITLDTSRIITESFFEVPATTIYPVSEQPSAKVVPTKFVSETDTSEWISSTTVEEKKRKEEEGTTGTASTFEVYSSTQRSDQLILPFELESPNVATSSDSGTRKSFMSLTTPTQSEREMTDSTPVFTETNTLENLGAQTTEHSSIHQPGVQEGLTTLPRSPASVFMEQGSGEAAADPETTTVSSFSLNVEYAIQAEKEVAGTLSPHVETTFSTEPTGLVLSTVMDRVVAENITQTSREIVISERLGEPNYGAEIRGFSTGFPLEEDFSGDFREYSTVSHPIAKEETVMMEGSGDAAFRDTQTSPSTVPTSVHISHISDSEGPSSTMVSTSAFPWEEFTSSAEGSGEQLVTVSSSVVPVLPSAVQKFSGTASSIIDEGLGEVGTVNEIDRRSTILPTAEVEGTKAPVEKEEVKVSGTVSTNFPQTIEPAKLWSRQEVNPVRQEIESETTSEEQIQEEKSFESPQNSPATEQTIFDSQTFTETELKTTDYSVLTTKKTYSDDKEMKEEDTSLVNMSTPDPDANGLESYTTLPEATEKSHFFLATALVTESIPAEHVVTDSPIKKEESTKHFPKGMRPTIQESDTELLFSGLGSGEEVLPTLPTESVNFTEVEQINNTLYPHTSQVESTSSDKIEDFNRMENVAKEVGPLVSQTDIFEGSGSVTSTTLIEILSDTGAEGPTVAPLPFSTDIGHPQNQTVRWAEEIQTSRPQTITEQDSNKNSSTAEINETTTSSTDFLARAYGFEMAKEFVTSAPKPSDLYYEPSGEGSGEVDIVDSFHTSATTQATRQESSTTFVSDGSLEKHPEVPSAKAVTADGFPTVSVMLPLHSEQNKSSPDPTSTLSNTVSYERSTDGSFQDRFREFEDSTLKPNRKKPTENIIIDLDKEDKDLILTITESTILEILPELTSDKNTIIDIDHTKPVYEDILGMQTDIDTEVPSEPHDSNDESNDDSTQVQEIYEAAVNLSLTEETFEGSADVLASYTQATHDESMTYEDRSQLDHMGFHFTTGIPAPSTETELDVLLPTATSLPIPRKSATVIPEIEGIKAEAKALDDMFESSTLSDGQAIADQSEIIPTLGQFERTQEEYEDKKHAGPSFQPEFSSGAEEALVDHTPYLSIATTHLMDQSVTEVPDVMEGSNPPYYTDTTLAVSTFAKLSSQTPSSPLTIYSGSEASGHTEIPQPSALPGIDVGSSVMSPQDSFKEIHVNIEATFKPSSEEYLHITEPPSLSPDTKLEPSEDDGKPELLEEMEASPTELIAVEGTEILQDFQNKTDGQVSGEAIKMFPTIKTPEAGTVITTADEIELEGATQWPHSTSASATYGVEAGVVPWLSPQTSERPTLSSSPEINPETQAALIRGQDSTIAASEQQVAARILDSNDQATVNPVEFNTEVATPPFSLLETSNETDFLIGINEESVEGTAIYLPGPDRCKMNPCLNGGTCYPTETSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGFNTFRCLCLPSYVGALCEQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIGLNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKGTVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAIPKITCMNPSAYQRTYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHRWSRRWQESRRA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu lektinami Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni Literatura red Zako M Shinomura T Ujita M Ito K Kimata K 1995 Expression of PG M V3 an alternatively spliced form of PG M without a chondroitin sulfate attachment in region in mouse and human tissues J Biol Chem 270 3914 3918 PubMed DOI 10 1074 jbc 270 8 3914 Yao L Y Moody C Schoenherr E Wight T N Sandell L J 1994 Identification of the proteoglycan versican in aorta and smooth muscle cells by DNA sequence analysis in situ hybridization and immunohistochemistry Matrix Biol 14 213 225 PubMed DOI 10 1016 0945 053X 94 90185 6 Iozzo R V Naso M F Cannizzaro L A Wasmuth J J McPherson J D 1992 Mapping of the versican proteoglycan gene CSPG2 to the long arm of human chromosome 5 5q12 5q14 Genomics 14 845 851 PubMed DOI 10 1016 S0888 7543 05 80103 X Bignami A Lane W S Andrews D Dahl D 1989 Structural similarity of hyaluronate binding proteins in brain and cartilage Brain Res Bull 22 67 70 PubMed DOI 10 1016 0361 9230 89 90129 9 Zimmermann D R Ruoslahti E 1989 Multiple domains of the large fibroblast proteoglycan versican EMBO J 8 2975 2981 PubMed Dours Zimmermann M T Zimmermann D R 1994 A novel glycosaminoglycan attachment domain identified in two alternative splice variants of human versican J Biol Chem 269 32992 32998 PubMedPrimitki red Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z VCAN pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2464 angl Arhiv originalu za 11 serpnya 2017 Procitovano 31 serpnya 2017 UniProt P13611 angl Arhiv originalu za 6 veresnya 2017 Procitovano 31 serpnya 2017 Div takozh red Hromosoma 5 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title VCAN amp oldid 35762266