www.wikidata.uk-ua.nina.az

TET2 англ Tet methylcytosine dioxygenase 2 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на 4 й хромосомі

TET2

TET2 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 223 811.

TET2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TET2, KIAA1546, MDS, tet methylcytosine dioxygenase 2, Tet methylcytosine dioxygenase 2, IMD75
Зовнішні ІД OMIM: 612839 MGI: 2443298 HomoloGene: 49498 GeneCards: TET2
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози, меланома, справжня поліцитемія, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз, blood platelet count
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54790
214133
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 4: 105.15 – 105.28 Mb Хр. 3: 133.17 – 133.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNG
DTKWHSFKSYYGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSE
PSLSGLLQIKKLKQDQKANGERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKES
VSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQILNEQEGKSANYHDKNIVLL
KNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSIAVQKTTSHIN
AINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADD
ADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGE
EFCSGSSSNLQAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPP
PSQLLLSPPPPLPQVPQLPSEGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVK
IEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERPQNNCVNRNDIQTAGTMTVPL
CSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEILKGRDKEQTR
DLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQM
TSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQH
LQFQKPSHQVHFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLK
QHLNQQASETEPFSNSHLLQHKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQI
KNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTKVEECFHGENQYSKSSEFETH
NVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHLVSENKEQTTH
PELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYK
NRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHA
ALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPEN
KTWKKVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKS
QKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTAASV
LNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTH
LGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVV
RRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTE
TLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKF
ARSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIE
YEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTR
EDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSF
RRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTK
QTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPH
HPQTESVNSYSASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYST
SSQAAGSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYS
PQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQN
MQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRLPPNLSNPNMD
YKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKM
LPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDS
EQSFLDPDIGGVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLV
FYQHKSMNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKSHGKKVK
REPAEPHETSEPTYLRFIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNR
YI

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК.

Література ред.

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 273 — 281.  PubMed DOI:10.1093/dnares/7.4.271
  • Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription.. Nature 493: 561 — 564.  PubMed DOI:10.1038/nature11742
  • Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico.. Int. J. Oncol. 25: 1193 — 1199.  PubMed

Примітки ред.

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TET2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25941 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка, скористайтеся підказкою та розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
TET2 angl Tet methylcytosine dioxygenase 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 4 j hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 002 aminokislot a molekulyarna masa 223 811 5 TET2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4NM6 5DEU 5D9YIdentifikatoriSimvoliTET2 KIAA1546 MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 Tet methylcytosine dioxygenase 2 IMD75Zovnishni ID OMIM 612839 MGI 2443298 HomoloGene 49498 GeneCards TET2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarak molochnoyi zalozi melanoma spravzhnya policitemiya miyelodisplastichnij sindrom gostrij miyeloyidnij lejkoz blood platelet count 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu oxidoreductase activity dioxygenase activity zinc ion binding DNA binding ferrous iron binding methylcytosine dioxygenase activity iron ion bindingKlitinna komponenta klitinne yadroBiologichnij proces 5 methylcytosine catabolic process klitinnij cikl GO 1904578 response to organic cyclic compound protein O linked glycosylation myeloid cell differentiation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II DNA demethylation histone H3 K4 trimethylation GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization oxidative demethylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez54790 214133Ensembl ENSG00000168769 ENSMUSG00000040943UniProt Q6N021 Q4JK59RefSeq mRNK NM 001127208NM 017628NM 001040400NM 145989NM 001346736RefSeq bilok NP 001120680NP 060098NP 001035490NP 001333665Lokus UCSC Hr 4 105 15 105 28 MbHr 3 133 17 133 25 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNGDTKWHSFKSYYGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSEPSLSGLLQIKKLKQDQKANGERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKESVSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQILNEQEGKSANYHDKNIVLLKNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSIAVQKTTSHINAINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADDADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGEEFCSGSSSNLQAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPPPSQLLLSPPPPLPQVPQLPSEGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVKIEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERPQNNCVNRNDIQTAGTMTVPLCSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEILKGRDKEQTRDLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQMTSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQHLQFQKPSHQVHFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLKQHLNQQASETEPFSNSHLLQHKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQIKNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTKVEECFHGENQYSKSSEFETHNVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHLVSENKEQTTHPELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYKNRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHAALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPENKTWKKVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTAASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVVRRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTETLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFARSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSFRRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTKQTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPHHPQTESVNSYSASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYSTSSQAAGSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYSPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRLPPNLSNPNMDYKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKMLPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDSEQSFLDPDIGGVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSMNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKSHGKKVKREPAEPHETSEPTYLRFIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNRYIA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz regulyatoriv hromatinu fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl alternativnij splajsing metilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom zaliza DNK Literatura red The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Nagase T Kikuno R Nakayama M Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVIII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 273 281 PubMed DOI 10 1093 dnares 7 4 271 Chen Q Chen Y Bian C Fujiki R Yu X 2013 TET2 promotes histone O GlcNAcylation during gene transcription Nature 493 561 564 PubMed DOI 10 1038 nature11742 Katoh M Katoh M 2004 Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico Int J Oncol 25 1193 1199 PubMedPrimitki red Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z TET2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 25941 angl Procitovano 18 veresnya 2017 UniProt Q6N021 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 18 veresnya 2017 Div takozh red Hromosoma 4 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska skoristajtesya pidkazkoyu ta rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Otrimano z https uk wikipedia org w index php title TET2 amp oldid 35741620