www.wikidata.uk-ua.nina.az

PTGDS англ Prostaglandin D2 synthase білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 9 ї

PTGDS

PTGDS (англ. Prostaglandin D2 synthase) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 029.

PTGDS
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTGDS, L-PGDS, LPGDS, PDS, PGD2, PGDS, PGDS2, prostaglandin D2 synthase
Зовнішні ІД OMIM: 176803 MGI: 99261 HomoloGene: 737 GeneCards: PTGDS
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5730
19215
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 9: 136.98 – 136.98 Mb Хр. 2: 25.36 – 25.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MATHHTLWMGLALLGVLGDLQAAPEAQVSVQPNFQQDKFLGRWFSAGLAS
NSSWLREKKAALSMCKSVVAPATDGGLNLTSTFLRKNQCETRTMLLQPAG
SLGSYSYRSPHWGSTYSVSVVETDYDQYALLYSQGSKGPGEDFRMATLYS
RTQTPRAELKEKFTAFCKAQGFTEDTIVFLPQTDKCMTEQ

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література Редагувати

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zahn M., Maeder M., Schmidt B., Bollensen E., Felgenhauer K. (1993). Purification and N-terminal sequence of beta-trace, a protein abundant in human cerebrospinal fluid.. Neurosci. Lett. 154: 93 — 95.  PubMed DOI:10.1016/0304-3940(93)90179-O
  • Giacomelli S., Leone M.-G., Grima J., Silvestrini B., Cheng C.Y. (1996). Astrocytes synthesize and secrete prostaglandin D synthetase in vitro.. Biochim. Biophys. Acta 1310: 269 — 276.  PubMed DOI:10.1016/0167-4889(95)00182-4
  • White D.M., Takeda T., DeGroot L.J., Stefansson K., Arnason B.G.W. (1997). Beta-trace gene expression is regulated by a core promoter and a distal thyroid hormone response element.. J. Biol. Chem. 272: 14387 — 14393.  PubMed DOI:10.1074/jbc.272.22.14387
  • Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD.. Mol. Cell. Proteomics: —.  PubMed DOI:10.1074/mcp.M111.013649
  • Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins.. J. Proteome Res. 12: 573 — 584.  PubMed DOI:10.1021/pr300963h

Примітки Редагувати

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9592 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. 

Див. також Редагувати


Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
PTGDS angl Prostaglandin D2 synthase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi 3 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 190 aminokislot a molekulyarna masa 21 029 4 PTGDSNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4OS8 2WWP 3O19 3O22 3O2Y 4IMN 4IMO 4ORR 4ORS 4ORU 4ORW 4ORX 4ORY 4OS0 4OS3IdentifikatoriSimvoliPTGDS L PGDS LPGDS PDS PGD2 PGDS PGDS2 prostaglandin D2 synthaseZovnishni ID OMIM 176803 MGI 99261 HomoloGene 737 GeneCards PTGDSOntologiya genaMolekulyarna funkciya transporter activity isomerase activity fatty acid binding prostaglandin D synthase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding small molecule binding retinoid bindingKlitinna komponenta citoplazma kompleks Goldzhi rough endoplasmic reticulum Yaderna membrana endoplasmic reticulum membrane membrana extracellular region endoplazmatichnij retikulum perinuclear region of cytoplasm ekzosoma klitinne yadro extracellular spaceBiologichnij proces prostaglandin metabolic process lipid metabolism cyclooxygenase pathway fatty acid metabolic process fatty acid biosynthetic process prostaglandin biosynthetic process regulation of circadian sleep wake cycle sleep GO 0015915 transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5730 19215Ensembl ENSG00000107317 ENSMUSG00000015090UniProt P41222Q5SQ11 O09114RefSeq mRNK NM 000954NM 008963RefSeq bilok NP 000945NP 032989Lokus UCSC Hr 9 136 98 136 98 MbHr 2 25 36 25 36 MbPubMed search 1 2 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MATHHTLWMGLALLGVLGDLQAAPEAQVSVQPNFQQDKFLGRWFSAGLASNSSWLREKKAALSMCKSVVAPATDGGLNLTSTFLRKNQCETRTMLLQPAGSLGSYSYRSPHWGSTYSVSVVETDYDQYALLYSQGSKGPGEDFRMATLYSRTQTPRAELKEKFTAFCKAQGFTEDTIVFLPQTDKCMTEQA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do izomeraz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak metabolizm zhirnih kislot metabolizm lipidiv transport biosintez zhirnih kislot biosintez lipidiv biosintez prostaglandiniv metabolizm prostaglandiniv Lokalizovanij u citoplazmi yadri membrani endoplazmatichnomu retikulumi aparati Goldzhi Takozh sekretovanij nazovni Literatura RedaguvatiThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Zahn M Maeder M Schmidt B Bollensen E Felgenhauer K 1993 Purification and N terminal sequence of beta trace a protein abundant in human cerebrospinal fluid Neurosci Lett 154 93 95 PubMed DOI 10 1016 0304 3940 93 90179 O Giacomelli S Leone M G Grima J Silvestrini B Cheng C Y 1996 Astrocytes synthesize and secrete prostaglandin D synthetase in vitro Biochim Biophys Acta 1310 269 276 PubMed DOI 10 1016 0167 4889 95 00182 4 White D M Takeda T DeGroot L J Stefansson K Arnason B G W 1997 Beta trace gene expression is regulated by a core promoter and a distal thyroid hormone response element J Biol Chem 272 14387 14393 PubMed DOI 10 1074 jbc 272 22 14387 Halim A Nilsson J Ruetschi U Hesse C Larson G 2011 Human urinary glycoproteomics attachment site specific analysis of N and O linked glycosylations by CID and ECD Mol Cell Proteomics PubMed DOI 10 1074 mcp M111 013649 Halim A Ruetschi U Larson G Nilsson J 2013 LC MS MS characterization of O glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins J Proteome Res 12 573 584 PubMed DOI 10 1021 pr300963hPrimitki Redaguvati Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9592 angl Procitovano 21 serpnya 2017 UniProt P41222 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 Div takozh RedaguvatiHromosoma 9 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title PTGDS amp oldid 38132993