www.wikidata.uk-ua.nina.az

H2AFX англ H2A histone family member X білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 11

H2AFX

H2AFX (англ. H2A histone family member X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 143 амінокислот, а молекулярна маса — 15 145.

H2AFX
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи H2AX, H2A.X, H2A/X, H2A histone family member X, H2A.X variant histone, H2AFX
Зовнішні ІД OMIM: 601772 MGI: 102688 HomoloGene: 134201 GeneCards: H2AX
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3014
15270
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 11: 119.09 – 119.1 Mb Хр. 9: 44.25 – 44.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPV
YLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGG
VTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPSGGKKATQASQEY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, мейоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література Редагувати

  • Mannironi C., Bonner W.M., Hatch C.L. (1989). H2A.X. a histone isoprotein with a conserved C-terminal sequence, is encoded by a novel mRNA with both DNA replication type and polyA 3' processing signals.. Nucleic Acids Res. 17: 9113 — 9126.  PubMed DOI:10.1093/nar/17.22.9113
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Rogakou E.P., Pilch D.R., Orr A.H., Ivanova V.S., Bonner W.M. (1998). DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139.. J. Biol. Chem. 273: 5858 — 5868.  PubMed DOI:10.1074/jbc.273.10.5858
  • Rogakou E.P., Boon C., Redon C., Bonner W.M. (1999). Megabase chromatin domains involved in DNA double-strand breaks in vivo.. J. Cell Biol. 146: 905 — 916.  PubMed DOI:10.1083/jcb.146.5.905
  • Rogakou E.P., Nieves-Neira W., Boon C., Pommier Y., Bonner W.M. (2000). Initiation of DNA fragmentation during apoptosis induces phosphorylation of H2AX histone at serine 139.. J. Biol. Chem. 275: 9390 — 9395.  PubMed DOI:10.1074/jbc.275.13.9390
  • Ward I.M., Chen J. (2001). Histone H2AX is phosphorylated in an ATR-dependent manner in response to replicational stress.. J. Biol. Chem. 276: 47759 — 47762.  PubMed DOI:10.1074/jbc.C100569200

Примітки Редагувати

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. (англ.). Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. 

Див. також Редагувати

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
H2AFX angl H2A histone family member X bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi 3 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 143 aminokislot a molekulyarna masa 15 145 4 H2AFXNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB2D31 2DYP 3SHV 3SQD 3SZM 1YDP 2AZM 3U3ZIdentifikatoriSimvoliH2AX H2A X H2A X H2A histone family member X H2A X variant histone H2AFXZovnishni ID OMIM 601772 MGI 102688 HomoloGene 134201 GeneCards H2AXOntologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0031493 histone binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein heterodimerization activity enzyme binding damaged DNA bindingKlitinna komponenta Nukleoplazma hromosoma telomera Nukleosoma ekzosoma nuclear speck centrosoma klitinne yadro site of double strand break Hromatin condensed nuclear chromosome male germ cell nucleus XY body replication fork site of DNA damageBiologichnij proces response to ionizing radiation nucleosome assembly DNA recombination DNA damage checkpoint signaling GO 1900404 positive regulation of DNA repair cellular response to DNA damage stimulus klitinne starinnya GO 0007126 mejoz cellular response to gamma radiation Spermatogenez cerebral cortex development klitinnij cikl GO 0022415 viral process double strand break repair via nonhomologous end joining double strand break repair GO 0100026 Reparaciya DNK double strand break repair via homologous recombination GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3014 15270Ensembl ENSG00000188486 ENSMUSG00000049932UniProt P16104 P27661RefSeq mRNK NM 002105NM 010436RefSeq bilok NP 002096NP 034566Lokus UCSC Hr 11 119 09 119 1 MbHr 9 44 25 44 25 MbPubMed search 1 2 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MSGRGKTGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGHYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGGVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTSATVGPKAPSGGKKATQASQEYA Alanin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus klitinnij cikl poshkodzhennya DNK reparaciya DNK rekombinaciya DNK mejoz acetilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri hromosomah Literatura RedaguvatiMannironi C Bonner W M Hatch C L 1989 H2A X a histone isoprotein with a conserved C terminal sequence is encoded by a novel mRNA with both DNA replication type and polyA 3 processing signals Nucleic Acids Res 17 9113 9126 PubMed DOI 10 1093 nar 17 22 9113 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Rogakou E P Pilch D R Orr A H Ivanova V S Bonner W M 1998 DNA double stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139 J Biol Chem 273 5858 5868 PubMed DOI 10 1074 jbc 273 10 5858 Rogakou E P Boon C Redon C Bonner W M 1999 Megabase chromatin domains involved in DNA double strand breaks in vivo J Cell Biol 146 905 916 PubMed DOI 10 1083 jcb 146 5 905 Rogakou E P Nieves Neira W Boon C Pommier Y Bonner W M 2000 Initiation of DNA fragmentation during apoptosis induces phosphorylation of H2AX histone at serine 139 J Biol Chem 275 9390 9395 PubMed DOI 10 1074 jbc 275 13 9390 Ward I M Chen J 2001 Histone H2AX is phosphorylated in an ATR dependent manner in response to replicational stress J Biol Chem 276 47759 47762 PubMed DOI 10 1074 jbc C100569200Primitki Redaguvati Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4739 angl Arhiv originalu za 17 zhovtnya 2015 Procitovano 8 veresnya 2017 UniProt P16104 angl Arhiv originalu za 18 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozh RedaguvatiHromosoma 11 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title H2AFX amp oldid 35449422