www.wikidata.uk-ua.nina.az

ARID5B англ AT rich interaction domain 5B білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

ARID5B

ARID5B (англ. AT-rich interaction domain 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 188 амінокислот, а молекулярна маса — 132 375.

ARID5B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ARID5B, DESRT, MRF-2, MRF2, AT-rich interaction domain 5B
Зовнішні ІД OMIM: 608538 MGI: 2175912 HomoloGene: 45872 GeneCards: ARID5B
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, Гострий лімфобластний лейкоз, lymphoblastic leukemia
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
84159
71371
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 10: 61.9 – 62.1 Mb Хр. 10: 67.93 – 68.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MEPNSLQWVGSPCGLHGPYIFYKAFQFHLEGKPRILSLGDFFFVRCTPKD
PICIAELQLLWEERTSRQLLSSSKLYFLPEDTPQGRNSDHGEDEVIAVSE
KVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGFHAGPVKTEALGRNGQKEALLKYRQST
LNSGLNFKDVLKEKADLGEDEEETNVIVLSYPQYCRYRSMLKRIQDKPSS
ILTDQFALALGGIAVVSRNPQILYCRDTFDHPTLIENESICDEFAPNLKG
RPRKKKPCPQRRDSFSGVKDSNNNSDGKAVAKVKCEARSALTKPKNNHNC
KKVSNEEKPKVAIGEECRADEQAFLVALYKYMKERKTPIERIPYLGFKQI
NLWTMFQAAQKLGGYETITARRQWKHIYDELGGNPGSTSAATCTRRHYER
LILPYERFIKGEEDKPLPPIKPRKQENSSQENENKTKVSGTKRIKHEIPK
SKKEKENAPKPQDAAEVSSEQEKEQETLISQKSIPEPLPAADMKKKIEGY
QEFSAKPLASRVDPEKDNETDQGSNSEKVAEEAGEKGPTPPLPSAPLAPE
KDSALVPGASKQPLTSPSALVDSKQESKLCCFTESPESEPQEASFPSFPT
TQPPLANQNETEDDKLPAMADYIANCTVKVDQLGSDDIHNALKQTPKVLV
VQSFDMFKDKDLTGPMNENHGLNYTPLLYSRGNPGIMSPLAKKKLLSQVS
GASLSSSYPYGSPPPLISKKKLIARDDLCSSLSQTHHGQSTDHMAVSRPS
VIQHVQSFRSKPSEERKTINDIFKHEKLSRSDPHRCSFSKHHLNPLADSY
VLKQEIQEGKDKLLEKRALPHSHMPSFLADFYSSPHLHSLYRHTEHHLHN
EQTSKYPSRDMYRESENSSFPSHRHQEKLHVNYLTSLHLQDKKSAAAEAP
TDDQPTDLSLPKNPHKPTGKVLGLAHSTTGPQESKGISQFQVLGSQSRDC
HPKACRVSPMTMSGPKKYPESLSRSGKPHHVRLENFRKMEGMVHPILHRK
MSPQNIGAARPIKRSLEDLDLVIAGKKARAVSPLDPSKEVSGKEKASEQE
SEGSKAAHGGHSGGGSEGHKLPLSSPIFPGLYSGSLCNSGLNSRLPAGYS
HSLQYLKNQTVLSPLMQPLAFHSLVMQRGIFTSPTNSQQLYRHLAAATPV
GSSYGDLLHNSIYPLAAINPQAAFPSSQLSSVHPSTKL

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Whitson R.H., Huang T., Itakura K. (1999). The novel Mrf-2 DNA-binding domain recognizes a five-base core sequence through major and minor-groove contacts.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 326 — 331.  PubMed DOI:10.1006/bbrc.1999.0643
  • Patsialou A., Wilsker D., Moran E. (2005). DNA-binding properties of ARID family proteins.. Nucleic Acids Res. 33: 66 — 80.  PubMed DOI:10.1093/nar/gki145
  • Healy J., Richer C., Bourgey M., Kritikou E.A., Sinnett D. (2010). Replication analysis confirms the association of ARID5B with childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia.. Haematologica 95: 1608 — 1611.  PubMed DOI:10.3324/haematol.2010.022459
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791.  PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Yuan Y.-C., Whitson R.H., Liu Q., Itakura K., Chen Y. (1998). A novel DNA-binding motif shares structural homology to DNA replication and repair nucleases and polymerases.. Nat. Struct. Biol. 5: 959 — 964.  PubMed DOI:10.1038/2934

Примітки ред.

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ARID5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17362 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
ARID5B angl AT rich interaction domain 5B bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 188 aminokislot a molekulyarna masa 132 375 5 ARID5BNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1IG6 2OEHIdentifikatoriSimvoliARID5B DESRT MRF 2 MRF2 AT rich interaction domain 5BZovnishni ID OMIM 608538 MGI 2175912 HomoloGene 45872 GeneCards ARID5BPov yazani genetichni zahvoryuvannyarevmatoyidnij artrit Gostrij limfoblastnij lejkoz lymphoblastic leukemia 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001105 transcription coactivator activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific histone demethylase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta Nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated liver development GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated histone demethylation kidney development nitrogen compound metabolic process male gonad development female gonad development post embryonic development fibroblast migration adrenal gland development multicellular organism growth fat cell differentiation platelet derived growth factor receptor signaling pathway cell development muscle organ morphogenesis skeletal system morphogenesis positive regulation of DNA binding transcription factor activity roof of mouth development face morphogenesis adipose tissue development fat pad development cellular response to leukemia inhibitory factor positive regulation of nucleic acid templated transcription GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez84159 71371Ensembl ENSG00000150347 ENSMUSG00000019947UniProt Q14865 Q8BM75RefSeq mRNK NM 001244638NM 032199NM 023598RefSeq bilok NP 001231567NP 115575NP 076087Lokus UCSC Hr 10 61 9 62 1 MbHr 10 67 93 68 11 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MEPNSLQWVGSPCGLHGPYIFYKAFQFHLEGKPRILSLGDFFFVRCTPKDPICIAELQLLWEERTSRQLLSSSKLYFLPEDTPQGRNSDHGEDEVIAVSEKVIVKLEDLVKWVHSDFSKWRCGFHAGPVKTEALGRNGQKEALLKYRQSTLNSGLNFKDVLKEKADLGEDEEETNVIVLSYPQYCRYRSMLKRIQDKPSSILTDQFALALGGIAVVSRNPQILYCRDTFDHPTLIENESICDEFAPNLKGRPRKKKPCPQRRDSFSGVKDSNNNSDGKAVAKVKCEARSALTKPKNNHNCKKVSNEEKPKVAIGEECRADEQAFLVALYKYMKERKTPIERIPYLGFKQINLWTMFQAAQKLGGYETITARRQWKHIYDELGGNPGSTSAATCTRRHYERLILPYERFIKGEEDKPLPPIKPRKQENSSQENENKTKVSGTKRIKHEIPKSKKEKENAPKPQDAAEVSSEQEKEQETLISQKSIPEPLPAADMKKKIEGYQEFSAKPLASRVDPEKDNETDQGSNSEKVAEEAGEKGPTPPLPSAPLAPEKDSALVPGASKQPLTSPSALVDSKQESKLCCFTESPESEPQEASFPSFPTTQPPLANQNETEDDKLPAMADYIANCTVKVDQLGSDDIHNALKQTPKVLVVQSFDMFKDKDLTGPMNENHGLNYTPLLYSRGNPGIMSPLAKKKLLSQVSGASLSSSYPYGSPPPLISKKKLIARDDLCSSLSQTHHGQSTDHMAVSRPSVIQHVQSFRSKPSEERKTINDIFKHEKLSRSDPHRCSFSKHHLNPLADSYVLKQEIQEGKDKLLEKRALPHSHMPSFLADFYSSPHLHSLYRHTEHHLHNEQTSKYPSRDMYRESENSSFPSHRHQEKLHVNYLTSLHLQDKKSAAAEAPTDDQPTDLSLPKNPHKPTGKVLGLAHSTTGPQESKGISQFQVLGSQSRDCHPKACRVSPMTMSGPKKYPESLSRSGKPHHVRLENFRKMEGMVHPILHRKMSPQNIGAARPIKRSLEDLDLVIAGKKARAVSPLDPSKEVSGKEKASEQESEGSKAAHGGHSGGGSEGHKLPLSSPIFPGLYSGSLCNSGLNSRLPAGYSHSLQYLKNQTVLSPLMQPLAFHSLVMQRGIFTSPTNSQQLYRHLAAATPVGSSYGDLLHNSIYPLAAINPQAAFPSSQLSSVHPSTKLA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri Literatura red The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PubMed DOI 10 1101 gr 2596504 Whitson R H Huang T Itakura K 1999 The novel Mrf 2 DNA binding domain recognizes a five base core sequence through major and minor groove contacts Biochem Biophys Res Commun 258 326 331 PubMed DOI 10 1006 bbrc 1999 0643 Patsialou A Wilsker D Moran E 2005 DNA binding properties of ARID family proteins Nucleic Acids Res 33 66 80 PubMed DOI 10 1093 nar gki145 Healy J Richer C Bourgey M Kritikou E A Sinnett D 2010 Replication analysis confirms the association of ARID5B with childhood B cell acute lymphoblastic leukemia Haematologica 95 1608 1611 PubMed DOI 10 3324 haematol 2010 022459 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PubMed DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Yuan Y C Whitson R H Liu Q Itakura K Chen Y 1998 A novel DNA binding motif shares structural homology to DNA replication and repair nucleases and polymerases Nat Struct Biol 5 959 964 PubMed DOI 10 1038 2934Primitki red Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z ARID5B pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17362 angl Procitovano 8 veresnya 2017 UniProt Q14865 angl Arhiv originalu za 22 zhovtnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozh red Hromosoma 10 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title ARID5B amp oldid 35337956