www.wikidata.uk-ua.nina.az

TOP1 англ Topoisomerase DNA I білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 20 ї хромос

TOP1

TOP1 (англ. Topoisomerase (DNA) I) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 90 726.

TOP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TOP1, TOPI, topoisomerase (DNA) I, DNA topoisomerase I
Зовнішні ІД OMIM: 126420 MGI: 98788 HomoloGene: 2467 GeneCards: TOP1
Реагує на сполуку
7-ethyl-10-hydroxycamptothecin, ar-67, edotecarin
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7150
21969
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 20: 41.03 – 41.12 Mb Хр. 2: 160.49 – 160.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKEKDREKSKHS
NSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKVRASGDA
KIKKEKENGFSSPPQIKDEPEDDGYFVPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPK
KIKTEDTKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKDKDKKVPEPDNKKKKPKKEEE
QKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPENVKFYYDGKVMKLS
PKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMTNEEKNIITNLSKC
DFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCIMDNHKERI
ANFKIEPPGLFRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHK
WKEVRHDNKVTWLVSWTENIQGSIKYIMLNPSSRIKGEKDWQKYETARRL
KKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEEGETAD
TVGCCSLRVEHINLHPELDGQEYVVEFDFLGKDSIRYYNKVPVEKRVFKN
LQLFMENKQPEDDLFDRLNTGILNKHLQDLMEGLTAKVFRTYNASITLQQ
QLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNHQRAPPKTFEKSMMNLQTK
IDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMK
LEVQATDREENKQIALGTSKLNYLDPRITVAWCKKWGVPIEKIYNKTQRE
KFAWAIDMADEDYEF

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

  • Kunze N., Klein M., Richter A., Knippers R. (1990). Structural characterisation of the human DNA topoisomerase I gene promoter.. Eur. J. Biochem. 194: 323 — 330.  PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb15620.x
  • Oddou P., Schmidt U., Knippers R., Richter A. (1988). Monoclonal antibodies neutralizing mammalian DNA topoisomerase I activity.. Eur. J. Biochem. 177: 523 — 529.  PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14404.x
  • Maul G.G., Jimenez S.A., Riggs E., Ziemnicka-Kotula D. (1989). Determination of an epitope of the diffuse systemic sclerosis marker antigen DNA topoisomerase I: sequence similarity with retroviral p30gag protein suggests a possible cause for autoimmunity in systemic sclerosis.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 8492 — 8496.  PubMed DOI:10.1073/pnas.86.21.8492
  • Khopde S., Simmons D.T. (2008). Simian virus 40 DNA replication is dependent on an interaction between topoisomerase I and the C-terminal end of T antigen.. J. Virol. 82: 1136 — 1145.  PubMed DOI:10.1128/JVI.01314-07
  • Onishi Y., Kawano Y. (2012). Rhythmic binding of Topoisomerase I impacts on the transcription of Bmal1 and circadian period.. Nucleic Acids Res. 40: 9482 — 9492.  PubMed DOI:10.1093/nar/gks779
  • Bandyopadhyay K., Li P., Gjerset R.A. (2012). CK2-mediated hyperphosphorylation of topoisomerase I targets serine 506, enhances topoisomerase I-DNA Binding, and increases cellular camptothecin sensitivity.. PLoS ONE. 7: E50427 — E50427.  PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0050427

Примітки ред.

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA topoisomerase I переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. (англ.). Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017. 

Див. також ред.


Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
TOP1 angl Topoisomerase DNA I bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 765 aminokislot a molekulyarna masa 90 726 5 TOP1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1A31 1A35 1A36 1EJ9 1K4S 1K4T 1LPQ 1NH3 1R49 1RR8 1RRJ 1SC7 1SEU 1T8I 1TL8IdentifikatoriSimvoliTOP1 TOPI topoisomerase DNA I DNA topoisomerase IZovnishni ID OMIM 126420 MGI 98788 HomoloGene 2467 GeneCards TOP1Reaguye na spoluku7 ethyl 10 hydroxycamptothecin ar 67 edotecarin 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA topoisomerase type I single strand cut ATP independent activity chromatin binding isomerase activity DNA topoisomerase activity core promoter sequence specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding DNA binding double stranded DNA binding single stranded DNA binding protein serine threonine kinase activity ATP binding protein domain specific binding supercoiled DNA binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta citoplazma Perikarion P body replication fork protection complex hromosoma nuclear chromosome klitinne yadro fibrillar center Nukleoplazma yaderce DNA topoisomerase type II double strand cut ATP hydrolyzing complex protein DNA complexBiologichnij proces Remodelyuvannya hromatinu embryonic cleavage GO 0010703 GO 0010702 zaprogramovana klitinna smert fosforilyuvannya ritmichnij proces chromosome segregation protein sumoylation circadian regulation of gene expression Replikaciya DNK cirkadnij ritm GO 0022415 viral process DNA topological change GO 0035404 peptidyl serine phosphorylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7150 21969Ensembl ENSG00000198900 ENSMUSG00000070544UniProt P11387 Q04750RefSeq mRNK NM 003286NM 009408RefSeq bilok NP 003277NP 033434Lokus UCSC Hr 20 41 03 41 12 MbHr 2 160 49 160 56 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKVRASGDAKIKKEKENGFSSPPQIKDEPEDDGYFVPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDTKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKDKDKKVPEPDNKKKKPKKEEEQKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPENVKFYYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMTNEEKNIITNLSKCDFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCIMDNHKERIANFKIEPPGLFRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVRHDNKVTWLVSWTENIQGSIKYIMLNPSSRIKGEKDWQKYETARRLKKCVDKIRNQYREDWKSKEMKVRQRAVALYFIDKLALRAGNEKEEGETADTVGCCSLRVEHINLHPELDGQEYVVEFDFLGKDSIRYYNKVPVEKRVFKNLQLFMENKQPEDDLFDRLNTGILNKHLQDLMEGLTAKVFRTYNASITLQQQLKELTAPDENIPAKILSYNRANRAVAILCNHQRAPPKTFEKSMMNLQTKIDAKKEQLADARRDLKSAKADAKVMKDAKTKKVVESKKKAVQRLEEQLMKLEVQATDREENKQIALGTSKLNYLDPRITVAWCKKWGVPIEKIYNKTQREKFAWAIDMADEDYEFA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do izomeraz topoizomeraz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus biologichni ritmi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri Literatura red Kunze N Klein M Richter A Knippers R 1990 Structural characterisation of the human DNA topoisomerase I gene promoter Eur J Biochem 194 323 330 PubMed DOI 10 1111 j 1432 1033 1990 tb15620 x Oddou P Schmidt U Knippers R Richter A 1988 Monoclonal antibodies neutralizing mammalian DNA topoisomerase I activity Eur J Biochem 177 523 529 PubMed DOI 10 1111 j 1432 1033 1988 tb14404 x Maul G G Jimenez S A Riggs E Ziemnicka Kotula D 1989 Determination of an epitope of the diffuse systemic sclerosis marker antigen DNA topoisomerase I sequence similarity with retroviral p30gag protein suggests a possible cause for autoimmunity in systemic sclerosis Proc Natl Acad Sci U S A 86 8492 8496 PubMed DOI 10 1073 pnas 86 21 8492 Khopde S Simmons D T 2008 Simian virus 40 DNA replication is dependent on an interaction between topoisomerase I and the C terminal end of T antigen J Virol 82 1136 1145 PubMed DOI 10 1128 JVI 01314 07 Onishi Y Kawano Y 2012 Rhythmic binding of Topoisomerase I impacts on the transcription of Bmal1 and circadian period Nucleic Acids Res 40 9482 9492 PubMed DOI 10 1093 nar gks779 Bandyopadhyay K Li P Gjerset R A 2012 CK2 mediated hyperphosphorylation of topoisomerase I targets serine 506 enhances topoisomerase I DNA Binding and increases cellular camptothecin sensitivity PLoS ONE 7 E50427 E50427 PubMed DOI 10 1371 journal pone 0050427Primitki red Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z DNA topoisomerase I pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11986 angl Arhiv originalu za 18 chervnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 UniProt P11387 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozh red Hromosoma 20 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title TOP1 amp oldid 38242126