www.wikidata.uk-ua.nina.az

ARID1A англ AT rich interaction domain 1A білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

ARID1A

ARID1A (англ. AT-rich interaction domain 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 285 амінокислот, а молекулярна маса — 242 045.

ARID1A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ARID1A, B120, BAF250, BAF250a, BM029, C1orf4, ELD, MRD14, OSA1, P270, SMARCF1, hELD, hOSA1, CSS2, AT-rich interaction domain 1A
Зовнішні ІД OMIM: 603024 MGI: 1935147 HomoloGene: 21216 GeneCards: ARID1A
Пов'язані генетичні захворювання
Coffin-Siris syndrome 2, liver carcinoma
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8289
93760
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. 1: 26.69 – 26.78 Mb Хр. 4: 133.68 – 133.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEM
KAAAGQESEGPAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDL
KNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGF
GQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQ
NSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSK
PPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLT
SPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAAS
GGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNP
YSQQQGPPSGPQQGHGYPGQPYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQ
IPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPPSQTPHAQPSY
QQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPP
YSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPP
QELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLP
MGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPV
GSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDR
GYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQIHTGMGSYQQNSMGSYGPQG
GQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQMHGQPGIPPY
GTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVA
MHVAANSIQNRPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYSM
GGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSS
STTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLD
LYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCL
YAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQST
SSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQ
KRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQ
GPNGGMGDPYSRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNM
STGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPS
GSPFPSQQTTMYQQQQQNYKRPMDGTYGPPAKRHEGEMYSVPYSTGQGQP
QQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYGNAYPATATAATERRPAGG
PQNQFPFQFGRDRVSAPPGTNAQQNMPPQMMGGPIQASAEVAQQGTMWQG
RNDMTYNYANRQSTGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGSWPSHGT
RQPPYGPSAPVPPMTRPPPSNYQPPPSMQNHIPQVSSPAPLPRPMENRTS
PSKSPFLHSGMKMQKAGPPVPASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQ
PVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDNS
IMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRF
SKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASEN
SEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGD
TTEHIQTHFESKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPD
GPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHR
NIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFE
MSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWW
DCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQ
DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYST
MVRFLSDRKNPVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLE
DSLAATQFQQSQASLLHMQNPPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSE
FTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLFLIGQS

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

  • Takeuchi T., Chen B.-K., Qiu Y., Sonobe H., Ohtsuki Y. (1997). Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats.. Gene 204: 71 — 77.  PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(97)00525-8
  • Lemon B., Inouye C., King D.S., Tjian R. (2001). Selectivity of chromatin-remodelling cofactors for ligand-activated transcription.. Nature 414: 924 — 928.  PubMed DOI:10.1038/414924a
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292.  PubMed DOI:10.1038/nbt1240
  • Martens J.A., Winston F. (2003). Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI/SNF complexes.. Curr. Opin. Genet. Dev. 13: 136 — 142.  PubMed DOI:10.1016/S0959-437X(03)00022-4
  • Kim S., Zhang Z., Upchurch S., Isern N., Chen Y. (2004). Structure and DNA-binding sites of the SWI1 AT-rich interaction domain (ARID) suggest determinants for sequence-specific DNA recognition.. J. Biol. Chem. 279: 16670 — 16676.  PubMed DOI:10.1074/jbc.M312115200
  • Hurlstone A.F., Olave I.A., Barker N., van Noort M., Clevers H. (2002). Cloning and characterization of hELD/OSA1, a novel BRG1 interacting protein.. Biochem. J. 364: 255 — 264.  PubMed

Примітки ред.

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ARID1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
  2. Human PubMed Reference:. 
  3. Mouse PubMed Reference:. 
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11110 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017. 
  5. (англ.). Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. 

Див. також ред.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
ARID1A angl AT rich interaction domain 1A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 285 aminokislot a molekulyarna masa 242 045 5 ARID1ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1RYUIdentifikatoriSimvoliARID1A B120 BAF250 BAF250a BM029 C1orf4 ELD MRD14 OSA1 P270 SMARCF1 hELD hOSA1 CSS2 AT rich interaction domain 1AZovnishni ID OMIM 603024 MGI 1935147 HomoloGene 21216 GeneCards ARID1APov yazani genetichni zahvoryuvannyaCoffin Siris syndrome 2 liver carcinoma 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001105 transcription coactivator activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding nuclear receptor binding nucleosome binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta nBAF complex SWI SNF complex Nukleoplazma npBAF complex klitinne yadro SWI SNF superfamily type complex brahma complexBiologichnij proces androgen receptor signaling pathway Remodelyuvannya hromatinu GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II cardiac muscle cell differentiation optic cup formation involved in camera type eye development placenta blood vessel development GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II toxin transport GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization transcription DNA templated nejrobiologiya rozvitku cardiac chamber development GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated neural tube closure nucleosome disassembly forebrain development intracellular estrogen receptor signaling pathway glucocorticoid receptor signaling pathway formation of primary germ layer gastrulyaciya embryo implantation stem cell population maintenanceDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8289 93760Ensembl ENSG00000117713 ENSMUSG00000007880UniProt O14497 A2BH40RefSeq mRNK NM 139135NM 006015NM 018450NM 001080819NM 001363070RefSeq bilok NP 006006NP 624361NP 001074288NP 001349999NP 001388200NP 001388202NP 001388204NP 001388205Lokus UCSC Hr 1 26 69 26 78 MbHr 4 133 68 133 76 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEGPAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLTSPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAASGGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQPYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQIHTGMGSYQQNSMGSYGPQGGQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQMHGQPGIPPYGTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVAMHVAANSIQNRPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYSMGGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSSSTTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQKRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQGPNGGMGDPYSRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNMSTGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPFPSQQTTMYQQQQQNYKRPMDGTYGPPAKRHEGEMYSVPYSTGQGQPQQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYGNAYPATATAATERRPAGGPQNQFPFQFGRDRVSAPPGTNAQQNMPPQMMGGPIQASAEVAQQGTMWQGRNDMTYNYANRQSTGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGSWPSHGTRQPPYGPSAPVPPMTRPPPSNYQPPPSMQNHIPQVSSPAPLPRPMENRTSPSKSPFLHSGMKMQKAGPPVPASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRFSKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASENSEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFESKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKNPVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQNPPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLFLIGQSA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do regulyatoriv hromatinu fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi nejrogenez polimorfizm acetilyaciya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri Literatura red Takeuchi T Chen B K Qiu Y Sonobe H Ohtsuki Y 1997 Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats Gene 204 71 77 PubMed DOI 10 1016 S0378 1119 97 00525 8 Lemon B Inouye C King D S Tjian R 2001 Selectivity of chromatin remodelling cofactors for ligand activated transcription Nature 414 924 928 PubMed DOI 10 1038 414924a Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PubMed DOI 10 1038 nbt1240 Martens J A Winston F 2003 Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI SNF complexes Curr Opin Genet Dev 13 136 142 PubMed DOI 10 1016 S0959 437X 03 00022 4 Kim S Zhang Z Upchurch S Isern N Chen Y 2004 Structure and DNA binding sites of the SWI1 AT rich interaction domain ARID suggest determinants for sequence specific DNA recognition J Biol Chem 279 16670 16676 PubMed DOI 10 1074 jbc M312115200 Hurlstone A F Olave I A Barker N van Noort M Clevers H 2002 Cloning and characterization of hELD OSA1 a novel BRG1 interacting protein Biochem J 364 255 264 PubMedPrimitki red Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z ARID1A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11110 angl Procitovano 28 serpnya 2017 UniProt O14497 angl Arhiv originalu za 17 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozh red Hromosoma 1 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title ARID1A amp oldid 35337932