www.wikidata.uk-ua.nina.az
Zele nij flyuoresce ntnij bilo k angl Green Fluorescent Protein GFP bilok masoyu 26 9 kDa sho skladayetsya z 238 aminokislotnih zalishkiv vpershe vidilenij z meduzi Aequorea victoria Aequorea aequorea Aequorea forskalea sho flyuorescuye zelenim svitlom pri zbudzhenni svitlom sinogo koloru 1 2 GFP z A victoria maye golovnij pik zbudzhennya z dovzhinoyu hvili 395 nm ta menshij pik z dovzhinoyu hvili 475 nm Pik jogo spektra viprominyuvannya pripadaye na 509 nm v zelenij chastini vidimogo spektra GFP vid morskogo karandasha Renilla reniformis maye odin pik zbudzhennya pri 498 nm Zaraz GFP shiroko vikoristovuyetsya v klitinnij i molekulyarnij biologiyi yak reporter ekspresiyi geniv ta vnutriklitinnoyi lokalizaciyi bilkiv 3 Z chasu vidkrittya na osnovi GFP metodami gennoyi inzheneriyi buli rozrobleni chislenni novi varianti yaki mayut znachno bilshij kvantovij vihid flyuorescenciyi ta mayut rizni kolri sinij sino zelenij zhovtij chervonij ta inshi flyuorescentni bilki abo mozhut zminyuvati kolir z chasom abo zalezhno vid umov vnutriklitinnogo seredovisha Gen GFP abo himernij bilok GFP z bud yakim inshim bilkom mozhe buti vvedenij do genomu organizmu i replikuvatisya razom z nim abo dlya ekspresiyi u nevelikij chastini bagatoklitinnogo organizmu mozhe buti vvedenij miscevoyu in yekciyeyu u skladi virusnogo vektora Zaraz modifikovani desyatki tisyach geniv bagatoh vidiv bakterij drizhdzhiv inshih gribiv roslin komah i kilkoh vidiv ssavciv vikoristovuyuchi GFP yak marker Strichkova diagrama GFP Dani PDB 1EMA Misha v klitinah yakoyi ekspresuyetsya GFPKonfokalna mikrofotografiya GFP pozitivnih nejralnih klitin poperednikiv zelenij kolir nyuhovoyi cibulini shura RECA 1 pozitivni krovonosni sudini chervonij kolir GFAP pozitivni astrociti sinij kolir Zmist 1 Istoriya 2 Struktura 3 Pohidni GFP 4 Div takozh 5 Posilannya 6 Resursi InternetuIstoriya RedaguvatiZelenij flyuorescentnij bilok buv vidilenij razom z inshim bilkom ekvorinom sho takozh svitivsya z meduzi Aequorea victoria Osamu Simomuroyu yakij v 1960 roci priyihav z Yaponiyi do Prinstonskogo universitetu i pochav vivchati biolyuminescenciyu meduz U 1960 1970 ti roki vin vidiliv obidva bilki i pochav doslidzhennya mehanizmu yihnogo svichennya Viyavilos sho v A victoria vzayemodiya ioniv kalciyu z ekvorinom viklikaye blakitne svichennya bilka Chastina ciyeyi biolyuminescenciyi perenositsya na zelenij flyuorescentnij bilok za dopomogoyu flyuorescentnogo rezonansnogo perenosu energiyi FRET cej bilok poglinaye sinye svitlo i viprominyuye svitlo zelenogo koloru sho v cilomu privodit do zelenogo zsuvu v svichenni meduzi Zastosuvannya GFP v molekulyarnij biologiyi pochalosya v 1990 h rokah U 1992 roci Duglas Presher sklonuvav i sekvenuvav gen bilka pislya chogo cherez nestachu finansuvannya vimushenij buv zakriti proekt i rozislav otrimanu DNK do kilkoh laboratorij zokrema do laboratoriyi Martina Chalfi U grupi Martina Chalfi bula zdijsnena ekspresiya bilka v bakteriyi Escherichia coli i chervi Caenorhabditis elegans rezultati ciyeyi roboti buli opublikuvani v zhurnali Science v 1994 roci Misyac opislya buli opublikovani nezalezhni rezultati z laboratoriyi Frederika Cuyi Viyavilos sho GFP prijmav nativnu konformaciyu i utvoryuvav flyuorofor pri kimnatnij temperaturi i bez dodavannya dodatkovih kofaktoriv sho zabezpechilo mozhlivist vikoristannya bilka yak markera v klitinah bagatoh organizmiv Kristalichna struktura bilka bula rozshifrovana v 1996 roci v laboratoriyi Remingtona Vona proyasnila mehanizm utvorennya flyuoroforu i rol navkolishnih aminokislot Ce dozvolilo otrimuvati mutanti GFP z pidvishenoyu stijkistyu z riznimi spektrami flyuorescenciyi ta inshimi pokrashenimi vlastivostyami v porivnyanni z bilkom dikogo tipu U 2008 Martin Chalfi Osamu Simomura i Rodzher Cyan otrimali Nobelivsku premiyu z himiyi za vidkrittya ta rozrobku zelenogo flyuorescentnogo bilka GFP Struktura Redaguvati nbsp Strichkova reprezentaciya povnogo bilka GFP ta GFP z viluchenoyu chastinoyu beta barelya sho pokazuyut flyuorofor zobrazhenij u reprezentaciyi shariv ta palichok PDB 1GFL GFP maye klasichnu strukturu beta barelya sho skladayetsya z odnogo b lista ta alfa spirali z flyuoroforom v centri 4 5 Shilno upakovanij beta list zahishaye flyuorofor vid gasinnya navkolishnim seredovishem a spryamovani useredinu bichni lancyugi beta barelya katalizuyut utvorennya tripeptidnogo kompleksu Ser65 Tyr66 Gly67 poznachennya polozhen dlya GFP dikogo tipu sho utvoryuyut flyuorofor Proces zgortannya prohodit cherez seriyu poslidovnih krokiv protyagom yakih zminyuyutsya optichni vlastivosti bilka ves proces u vipadku GFP dikogo tipu zajmaye bilya 30 40 hvilin i nazivayetsya dozrivannyam bilka Deyaki modifikovani versiyi bilka mozhut mati yak znachno korotshij napriklad Venus tak i znachno dovshij chas dozrivannya Pohidni GFP Redaguvati nbsp Riznomanittya genetichnih mutacij na prikladi cogo zobrazhennya namalovanogo zhivimi bakteriyami sho ekspresuyut 8 tipiv flyuorescentnih bilkiv riznogo koloru Cherez znachnij potencial dlya bagatoh zastosuvan buli rozrobleni chislenni varianti GFP 6 Pershe znachne pokrashennya bulo zdijsnene za dopomogoyu odniyeyi tochkovoyi mutaciyi S65T povidomlenoyi v 1995 roci v zhurnali Nature Rodzherom Cyanem 7 Cya mutaciya znachno pokrashila spektralni harakteristiki GFP zokrema privela do zbilshennya kvantovogo vihodu flyuorescenciyi fotostabilnosti ta zbilshennya stoksovogo zsuvu takim chinom sho maksimum poglinannya opinivsya na 488 nm todi yak maksimum viprominyuvannya zalishivsya na 509 nm Take polozhennya maksimumiv privelo do dobrogo svivpadannya spektriv GFP ta flyuoresceyinu FITC sho dozvolilo vikoristannya tih samih filtriv zbilshuyuchi privablivist dlya bagatoh doslidnikiv Dodannya she odnoyi tochkovoyi mutaciyi F64L privelo do mozhlivosti efektivnogo zgortannya bilka pri temperaturi 37 C cej variant bilka otrimav nazvu EGFP angl enhanced EGFP maye koeficiyent poglinannya abo optichnij poperechnij pereriz poznachayetsya e 9 13 10 21 m molekulu abo 55000 M 1sm 1 8 jogo kvantovij vihid QY stanovit 0 60 Vidnosna yaskravist e QY takim chinom stanovit 33000 M 1sm 1 U 2006 roci z yavilosya povidomlennya pro superzgortayuchijsya GFP superfolder GFP modifikovanij v bagatoh miscyah variant GFP sho zgortayetsya pomitno shvidshe za GFP dikogo tipu navit u vipadkah koli cej bilok zv yazanij z inshim bilkom sho zgortayetsya duzhe povilno 9 Bagato inshih mutacij vklyuchayut riznokolorovi versiyi cogo bilka sered nih populyarni pohidni blakitnogo flyuorescentnogo bilka EBFP EBFP2 Azurite mKalama1 cianovogo flyuorescentnogo bilka ECFP Cerulean CyPet i zhovtogo flyuorescentnogo bilka YFP Citrine Venus YPet Pohidni BFP okrim mKalama1 mistyat mutaciyu Y66H Kritichnoyu mutaciyeyu dlya stvorennya CFP ye Y66W sho viklikaye utvorennya hromoforu z indolnoyu strukturoyu zamist fenolnoyi Dodavannya ciyeyi mutaciyi vimagaye kilkoh dodatkovih mutacij u beta bareli sho dozvolyaye vidnoviti yaskravist bilka zmenshenu cherez sterichni obmezhennya viklikani bilshim rozmirom indolonoyi grupi v porivnyanni z fenolnoyu Chervonij zsuv YFP ta jogo pohidnih zdijsnyuyetsya za dopomogoyu mutaciyi T203Y ta viklikayetsya vzayemodiyeyu stekingu p elektronnih orbitalej zgadanogo zalishku tirozinu ta hromoforu 2 Dva ostanni klasi spektralnih variantiv pohidni CFP ta YFP chasto vikoristovuyutsya dlya flyuorescentnogo rezonansnogo perenosu energiyi FRET Genetichno kodovani reporteri FRET chutlivi do deyakih signalnih molekul takih yak kalcij ta glutamat stanu fosforilyuvannya deyakih bilkiv dimerizaciyi bilkiv ta inshih procesiv klitinnoyi aktivnosti Napivracionalnij mutagenez bagatoh zalishkiv priviv do stvorennya variantiv GFP chutlivih do kislotnosti seredovisha tak zvanih pH lyuoriniv pHluorins Tak vikoristovuyuchi shvidku zminu kislotnosti pri endocitozi sinaptichnih vezikul pH lyuorini zv yazani z sinaptobrevinom uspishno vikoristovuvalisya dlya vizualizaciyi sinaptichnoyi aktivnosti nejroniv 10 Nomenklatura modifikovanih variantiv GFP chasto superechliva ta nezrozumila cherez vikoristannya odniyeyi nazvi dlya klikoyi nepov yazanih variantiv Tak mGFP mozhe poznachati GFP z N terminalnim palmitolyuvannyam sho zmushuye GFP zv yazuvatisya z klitinnimi membranami prote cya nazva takozh vikoristovuyetsya dlya poznachennya monomernogo GFP stvorenogo za dopomogoyu mutaciyi A206K na poverhni vzayemodiyi dimeriv GFP dikogo tipu maye deyaku tendenciyu do dimerizaciyi pri koncentraciyah ponad 5 mg ml mGFP takozh mozhe poznachati modifikovanij GFP optimizovanij zaminoyu kilkoh aminokislot dlya stabilnoyi ekspresiyi v klitinah roslin Div takozh RedaguvatiBiolyuminescenciyaPosilannya Redaguvati Prendergast F Mann K 1978 Chemical and physical properties of aequorin and the green fluorescent protein isolated from Aequorea forskalea Biochemistry 17 17 3448 53 PMID 28749 a b Tsien R 1998 The green fluorescent protein Annu Rev Biochem 67 509 44 PMID 9759496 Arhiv originalu za 28 lipnya 2020 Procitovano 21 sichnya 2008 Phillips G 2001 Green fluorescent protein a bright idea for the study of bacterial protein localization FEMS Microbiol Lett 204 1 9 18 PMID 11682170 Ormo M Cubitt A Kallio K Gross L Tsien R Remington S 1996 Crystal structure of the Aequorea victoria green fluorescent protein Science 273 5280 1392 5 PMID 8703075 doi 10 1126 science 273 5280 1392 Yang F Moss L Phillips G 1996 The molecular structure of green fluorescent protein Nat Biotechnol 14 10 1246 51 PMID 9631087 doi 10 1038 nbt1096 1246 Shaner N Steinbach P Tsien R 2005 A guide to choosing fluorescent proteins Nat Methods 2 12 905 9 PMID 16299475 doi 10 1038 nmeth819 Arhiv originalu za 16 kvitnya 2021 Procitovano 18 zhovtnya 2008 Heim R Cubitt A Tsien R 1995 Improved green fluorescence Nature 373 6516 663 4 PMID 7854443 doi 10 1038 373663b0 Arhiv originalu za 29 zhovtnya 2008 Procitovano 18 zhovtnya 2008 Shelley R McRae Christopher L Brown and Gillian R Bushell May 2005 Rapid purification of EGFP EYFP and ECFP with high yield and purity Protein Expression and Purification 41 1 121 127 PMID 15802229 doi 10 1016 j pep 2004 12 030 Pedelacq J Cabantous S Tran T Terwilliger T Waldo G 2006 Engineering and characterization of a superfolder green fluorescent protein Nat Biotechnol 24 1 79 88 PMID 16369541 doi 10 1038 nbt1172 Miesenbock G De Angelis D Rothman J 1998 Visualizing secretion and synaptic transmission with pH sensitive green fluorescent proteins Nature 394 6689 192 5 PMID 9671304 doi 10 1038 28190 Resursi Internetu RedaguvatiVikishovishe maye multimedijni dani za temoyu Zelenij flyuorescentnij bilokGFP sajt Arhivovano 30 listopada 2015 u Wayback Machine angl Vvedennya do flyuorescentnih bilkiv Arhivovano 26 grudnya 2008 u Wayback Machine angl Istoriya vikoristannya i struktura GFP Arhivovano 30 listopada 2015 u Wayback Machine angl Bibliografiya golovnih statej pro GFP Arhivovano 13 lipnya 2017 u Wayback Machine angl Java aplet sho demonstruye himiyu utvorennya flyuoroforu GFP angl Laboratoriya Cyana UCSD Arhivovano 26 sichnya 2008 u Wayback Machine angl Video vistupu Cyana pid chas nagorodzhennya nobelivskoyu premiyeyu Arhivovano 29 zhovtnya 2008 u Wayback Machine angl Spektri riznomanitshih variantiv flyuorescentnih bilkiv Arhivovano 21 grudnya 2019 u Wayback Machine angl Hronologiya doslidzhen GFP Arhivovano 20 zhovtnya 2008 u Wayback Machine angl Fakti pro Aequorea dzherelo GFP Arhivovano 6 zhovtnya 2010 u Wayback Machine angl nbsp Ce nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title Zelenij flyuorescentnij bilok amp oldid 40195776