Перший Досліджуваний Варіант у грудні 2020 року (англ. The first Variant Under Investigation in December 2020 абревіатура VUI — 202012/01 затверджена як офіційна скорочена назва) а також відомий як гілка B.1.1.7, — варіант SARS-CoV-2, вірусу, який викликає COVID-19. Вперше варіант був виявлений у Великій Британії у жовтні 2020 року на вибірці, відібраній попереднього місяця і він швидко почав поширюватися до середини грудня. Це корелює зі значним збільшенням рівня зараження COVID-19 у Великій Британії; вважається, що це збільшення є принаймні частково обумовленим мутацією N501Y всередині рецептор-зв'язувального домену спайкового глікопротеїну, який необхідний для зв'язування з Ангіотензинперетворювальним ферментом 2 в клітинах людини.
Альфа-варіант SARS-CoV-2 | |
Офіційна назва | англ. Alpha |
---|---|
Названо на честь | альфа |
Дата відкриття (винаходу) | 20 вересня 2020 |
Місце відкриття | Велика Британія |
Кількість випадків | 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 3, 3, 4, 4, 4, 4, 5, 7, 10, 13, 15, 17, 21, 21, 21, 21, 22, 22, 23, 30, 40, 42, 50, 56, 80, 89, 89, 95, 98, 99, 114, 213, 132, 370 і 24 364 |
Підтримується Вікіпроєктом | WikiProject COVID-19d і Проєкт:Велика Британія |
Альфа-варіант SARS-CoV-2 у Вікісховищі |
Генетика ред.
Мутації SARS-CoV-2 є розповсюдженими: за даними консорціуму Геноміки Коронавірусної хвороби Великої Британії (COG-UK), лише у поверхневих глікопротеїнах («шипах» вірусу) виявлено понад 4000 мутацій. Зосередження уваги на мутаціях є загальним способом відстеження поширення вірусу. Окрім того, що, наприклад, показано, що SARS-CoV-2 прибув до Великої Британії з понад 1000 окремих випадків, він також показує, що варіант з мутацією G614 повністю замінив попередній D614.
Варіант VUI — 202012/01 визначається 17 мутаціями включаючи декілька в пепломері: мутація 69–70, мутація 144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H. Здається, однією з найважливіших мутацій є мутація N501Y — перехід від аспарагіну (N) до тирозину (Y) в амінокислотному положенні 501. Це пов'язано з його положенням всередині рецептор-зв'язувального домену (RBD) пепломера, який зв'язується з Ангіотензинперетворювальним ферментом 2. Мутації в RBD можуть призвести до того, що вірус стає більш заразним.
Виявлення ред.
VUI-202012/01 був виявлений в жовтні 2020 року консорціумом Геноміки Коронавірусної хвороби Великої Британії (COG-UK) на вибірці, відібраній у вересні того ж року.
Характеристика ред.
Заразність ред.
На засіданні телеконференції 18 грудня 2020 року NERVTAG дійшов висновку, що вони більш-менш впевнені, що VUI-202012/01 є значно більш заразним, ніж інші варіанти, але що даних для досягнення будь-якого висновку щодо основного механізму підвищеної заразності (наприклад, збільшення вірусного навантаження) недостатньо, розподіл вірусів у тканинах, серійний інтервал тощо), віковий розподіл випадків або тяжкість захворювання.
Прем'єр-міністр Великої Британії Борис Джонсон заявив 19 грудня 2020 року, що новий варіант може бути на 70 % більш заразним, ніж попередні варіанти, хоча існує «значна невизначеність». Французький уряд заперечив думку Джонсона, заявивши, що «на цьому етапі це не було підтверджено». Вівек Мурті, який є колишнім головним лікарем США і нині є кандидатом на посаду головного лікаря та співголовою Консультативної ради COVID-19, погодився з Джонсоном, що варіант, здається, більш заразний.
Поширення ред.
Перший випадок був, ймовірно, у середині вересня в Лондоні чи Кенті, Велика Британія. Станом на 13 грудня 2020 року у Великій Британії було виявлено 1108 випадків з цим варіантом у майже 60 різних місцевих органах влади. Ці випадки були переважно на південному сході Англії. Варіант також ідентифікований в Уельсі та Шотландії. 20 грудня 2020 року BBC повідомила, що Всесвітня організація охорони здоров'я (ВООЗ) заявила, що дев'ять випадків нового варіанту були зареєстровані в Данії та по одному в Нідерландах та Австралії. Пізніше того ж дня було повідомлено, що чотири були виявлені в Бельгії а один — в Італії. Сполучене Королівство та Данія проводять послідовність розслідувань своїх випадків коронавірусу значно вищими показниками, ніж більшість інших і вважалося ймовірним, що інші країни виявлять цей варіант пізніше. У Південній Африці також був виявлений штам з тією ж мутацією N501Y (що може призвести до вищої заразності), але він відрізняється від штаму Великої Британії. Мутація N501Y була виявлена і в інших місцях: в Австралії в червні — липні, США в липні та Бразилії в квітні, і поки не ясно, чи виникла вона спонтанно у Великій Британії, чи була імпортована.
Примітки ред.
- Записується як VUI 202012/01 (англ. Variant Under Investigation, рік 2020, місяць 12, варіант 01). Джерело: GISAID і ECDC.
Джерела ред.
- https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ↑ https://cov-lineages.org/global_report_B.1.1.7.html
- Rambaut A., Loman N. J., Pybus O. G. та ін. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations. — 2020.
- . Public Health England. 14 грудня 2020. Архів оригіналу за 15 грудня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- . GISAID. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 20 грудня 2020.
- . European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 17 грудня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- Kupferschmidt, Kai; 2020 (20 грудня 2020). . Science | AAAS (англ.). Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- ↑ . BBC News. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- ↑ Wise, Jacqui (16 грудня 2020). . BMJ (англ.) 371. ISSN 1756-1833. PMID 33328153. doi:10.1136/bmj.m4857. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Cell 182 (4): 812–827.e19. 20 серпня 2020. doi:10.1016/j.cell.2020.06.043. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020 — через ScienceDirect.
- For a list of the symbols used for the α-amino acids incorporated into protein under mRNA direction, see:
- New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (18 грудня 2020). . Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- ↑ . BBC News. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . BBC News. 19 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Metro. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- GRIESHABER, KIRSTEN; HUI, SYLVIA (20 грудня 2020). . chicagotribune.com. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- Berger, Miriam (20 грудня 2020). . Washington Post (амер.). ISSN 0190-8286. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 20 грудня 2020.
- Higgins-Dunn, N. (19 грудня 2020). . MSNBC. Архів оригіналу за 26 листопада 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- . www.sanger.ac.uk (амер.). Архів оригіналу за 13 вересня 2020. Процитовано 19 грудня 2020.
- Henley, Jon; Jones, Sam; Giuffrida, Angela; Holmes, Oliver (20 грудня 2020). . The Guardian. Архів оригіналу за 30 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . The Brussel Times. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . la Repubblica (італ.). 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 2 січня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- Knudsen, T.H. (20 грудня 2020). . Данське радіо (дан.). Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . New York Times. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Science Mag. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.