www.wikidata.uk-ua.nina.az

DrugBank база даних доступна в Альбертському університеті 1 містить біоінформатичні та хемоінформатичні ресурси які поєд

DrugBank

DrugBank — база даних доступна в Альбертському університеті, містить біоінформатичні та хемоінформатичні ресурси, які поєднують в собі деталі препаратів (тобто хімічні, фармакологічні та фармацевтичні) дані з всесторонньою препаративною ціллю (тобто послідовність, структура, шляхи) інформації. База даних містить інформацію про 4 800 лікарських речовин, включаючи:

Для 2500 білкових цілей для лікарських речовин, додані їх амінокислотні послідовності.

Кожен запис (DrugCard) містить більше 100 полів, з яких більше половини є хімічними і фармакологічними даними, інша половина містить інформацію про цілі дії ліків.

Сайт і база даних DrugBank в цей час підтримується Девідом Уішартом і Крейгом Ноксом.

Обсяг і доступ Редагувати

Усі дані в DrugBank отримані з публічних непатентованих джерел. Майже кожен елемент даних повністю простежується та містить чітке посилання на першоджерело. Дані DrugBank доступні через публічний вебінтерфейс.

Користувачі можуть надсилати запити до DrugBank кількома способами:

  • Підтримуються прості текстові запити всієї текстової складової бази даних. Натискання кнопки «Огляд» генерує табличний синопсис вмісту DrugBank. Це подання дозволяє користувачам невимушено прокручувати базу даних або пересортувати її вміст.
  • Натискання кнопки DrugCard відкриває повний вміст даних для відповідного препарату. Там наведено повне пояснення всіх полів і джерел DrugCard.
  • Кнопка PharmaBrowse дозволяє користувачам переглядати препарати, згруповані за показаннями. Це особливо корисно для фармацевтів і лікарів, а також для фармацевтичних дослідників, які шукають потенційних потенційних клієнтів.
  • Кнопка ChemQuery дозволяє користувачам малювати (за допомогою аплетів ChemAxon) або писати (як рядок SMILES) хімічну сполуку та шукати в DrugBank хімічні речовини, подібні або ідентичні запитуваній сполукі.
  • Кнопка TextQuery підтримує більш складний текстовий пошук (часткові збіги слів, чутливість до регістру, орфографічні помилки тощо) у текстовій частині DrugBank.
  • Кнопка SeqSearch дозволяє користувачам здійснювати пошук послідовностей BLAST (білків) у 18 000 послідовностях, що містяться в DrugBank. Підтримуються запити BLAST як однієї, так і кількох послідовностей (тобто цілого протеома).
  • Кнопка Data Extractor відкриває простий у користуванні інструмент пошуку реляційних запитів, який дозволяє користувачам вибирати або здійснювати пошук у різних комбінаціях підполів. Data Extractor — це найдосконаліший інструмент пошуку для DrugBank.

Користувачі можуть відстежувати останні новини про DrugBank через регулярні стрічки новин на його вебсайті, а також через Twitter і Facebook.

Див. також Редагувати

  • ChEMBL
  • Метаболізм ліків
  • HMDB (Human Metabolome Database)
  • KEGG
  • Перелік біологічних баз даних (List of biological databases)
  • Фармакологія
  • SMPDB (Small Molecule Pathway Database)
  • T3DB (Toxin and Toxin-Target Database)
  • База даних терапевтичних цілей (Therapeutic Targets Database)

Примітки Редагувати

  1. ↑ Wishart DS, Knox C, Guo AC, et al. (2008). DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets. Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D901–6. PMID 18048412. doi:10.1093/nar/gkm958. 
  2. ↑ Wishart DS, Knox C, Guo AC, et al. (2006). . Nucleic Acids Research 34 (Database issue): D668–D672. PMID 16381955. doi:10.1093/nar/gkj067. Архів оригіналу за 27 квітня 2007. Процитовано 29 квітня 2011. 
  3. Wishart, David S. DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration. Nucleic Acids Research 34 (suppl_1): 668–672. 

Посилання Редагувати

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри
Дата публікації:
DrugBank baza danih dostupna v Albertskomu universiteti 1 mistit bioinformatichni ta hemoinformatichni resursi yaki poyednuyut v sobi detali preparativ tobto himichni farmakologichni ta farmacevtichni dani z vsestoronnoyu preparativnoyu cillyu tobto poslidovnist struktura shlyahi informaciyi Baza danih mistit informaciyu pro 4 800 likarskih rechovin vklyuchayuchi gt 1480 spoluk shvalenih FDA 128 biologichnih preparativ gt 71 nutricevtik gt 3200 eksperimentalnih spoluk 2 Dlya 2500 bilkovih cilej dlya likarskih rechovin dodani yih aminokislotni poslidovnosti 2 Kozhen zapis DrugCard mistit bilshe 100 poliv z yakih bilshe polovini ye himichnimi i farmakologichnimi danimi insha polovina mistit informaciyu pro cili diyi likiv Sajt i baza danih DrugBank v cej chas pidtrimuyetsya Devidom Uishartom i Krejgom Noksom 1 Zmist 1 Obsyag i dostup 2 Div takozh 3 Primitki 4 PosilannyaObsyag i dostup RedaguvatiUsi dani v DrugBank otrimani z publichnih nepatentovanih dzherel Majzhe kozhen element danih povnistyu prostezhuyetsya ta mistit chitke posilannya na pershodzherelo Dani DrugBank dostupni cherez publichnij vebinterfejs 3 Koristuvachi mozhut nadsilati zapiti do DrugBank kilkoma sposobami Pidtrimuyutsya prosti tekstovi zapiti vsiyeyi tekstovoyi skladovoyi bazi danih Natiskannya knopki Oglyad generuye tablichnij sinopsis vmistu DrugBank Ce podannya dozvolyaye koristuvacham nevimusheno prokruchuvati bazu danih abo peresortuvati yiyi vmist Natiskannya knopki DrugCard vidkrivaye povnij vmist danih dlya vidpovidnogo preparatu Tam navedeno povne poyasnennya vsih poliv i dzherel DrugCard Knopka PharmaBrowse dozvolyaye koristuvacham pereglyadati preparati zgrupovani za pokazannyami Ce osoblivo korisno dlya farmacevtiv i likariv a takozh dlya farmacevtichnih doslidnikiv yaki shukayut potencijnih potencijnih kliyentiv Knopka ChemQuery dozvolyaye koristuvacham malyuvati za dopomogoyu apletiv ChemAxon abo pisati yak ryadok SMILES himichnu spoluku ta shukati v DrugBank himichni rechovini podibni abo identichni zapituvanij spoluki Knopka TextQuery pidtrimuye bilsh skladnij tekstovij poshuk chastkovi zbigi sliv chutlivist do registru orfografichni pomilki tosho u tekstovij chastini DrugBank Knopka SeqSearch dozvolyaye koristuvacham zdijsnyuvati poshuk poslidovnostej BLAST bilkiv u 18 000 poslidovnostyah sho mistyatsya v DrugBank Pidtrimuyutsya zapiti BLAST yak odniyeyi tak i kilkoh poslidovnostej tobto cilogo proteoma Knopka Data Extractor vidkrivaye prostij u koristuvanni instrument poshuku relyacijnih zapitiv yakij dozvolyaye koristuvacham vibirati abo zdijsnyuvati poshuk u riznih kombinaciyah pidpoliv Data Extractor ce najdoskonalishij instrument poshuku dlya DrugBank Koristuvachi mozhut vidstezhuvati ostanni novini pro DrugBank cherez regulyarni strichki novin na jogo vebsajti a takozh cherez Twitter i Facebook Div takozh RedaguvatiChEMBL Metabolizm likiv HMDB Human Metabolome Database KEGG Perelik biologichnih baz danih List of biological databases Farmakologiya SMPDB Small Molecule Pathway Database T3DB Toxin and Toxin Target Database Baza danih terapevtichnih cilej Therapeutic Targets Database Primitki Redaguvati a b Wishart DS Knox C Guo AC et al 2008 DrugBank a knowledgebase for drugs drug actions and drug targets Nucleic Acids Research 36 Database issue D901 6 PMID 18048412 doi 10 1093 nar gkm958 a b Wishart DS Knox C Guo AC et al 2006 DrugBank a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration Nucleic Acids Research 34 Database issue D668 D672 PMID 16381955 doi 10 1093 nar gkj067 Arhiv originalu za 27 kvitnya 2007 Procitovano 29 kvitnya 2011 Wishart David S DrugBank a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration Nucleic Acids Research 34 suppl 1 668 672 Posilannya RedaguvatiOficijnij sajt DrugBank Canada Arhivovano 21 listopada 2017 u Wayback Machine Otrimano z https uk wikipedia org w index php title DrugBank amp oldid 39765596