Тета-варіант, також відомий як лінія P.3, , є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVI-19 . Варіант був вперше ідентифікований на Філіппінах 18 лютого 2021 року, коли на Центральних Вісайських островах було виявлено дві мутації, що викликають занепокоєня. Він був виявлений в Японії 12 березня 2021 року, коли мандрівник з Філіппін прибув до міжнародного аеропорту Наріта во Токіо.
| Тета-варіант SARS-CoV-2 | |
| Офіційна назва | англ. Theta (31 травня 2021) |
|---|---|
| Названо на честь | тета |
| Дата відкриття (винаходу) | січень 2021 |
| Місце відкриття | Філіппіни |
| Тета-варіант SARS-CoV-2 у Вікісховищі |
Він відрізняється від тих, які вперше були виявлені у Сполученому Королівстві, Південній Африці та Бразилії, і, як вважають, представляє подібну загрозу. Варіант більш стійкий до нейтралізуючих антитіл, у тому числі отриманих внаслідок вакцинації, як, наприклад, південноафриканський та бразильський варіанти.
Відповідно до спрощеної схеми найменування, запропонованої Всесвітньою організацією охорони здоров’я, P.3 позначено як Тета-варіант, і вважається варіантом, що викликає інтерес (VOI), але ще не варіантом, що викликає занепокоєння.
Станом на липень 2021 року Тета більше не розглядається ВООЗ як варіант, який цікавить.
Класифікація ред.
Іменування ред.
17 березня 2021 року Служба охорони здоров’я Англії (PHE) назвала Lineage P.3 VUI-21MAR-02.
1 червня 2021 року Всесвітня організація охорони здоров’я (ВООЗ) назвала лінію P.3 тета-варіантом.
Мутації ред.
Загалом у всіх зразках (позначених red нижче) спостерігали 14 замін амінокислот, включаючи сім мутацій білка . Серед мутацій спайкового білка чотири раніше були пов’язані з лініями, що викликають занепокоєння (тобто, E484K, N501Y, D614G та P681H), тоді як три додаткові заміни спостерігалися у напрямку С-кінцевої області білка (тобто E1092K, H1101Y та V1176F). У всіх зразках також була виявлена одна амінокислотна заміна на N-кінці ORF8 (тобто K2Q). Три інші мутації були помічені в 32 з 33 зразків (позначених green ), включаючи делецію трьох амінокислот у позиціях білка спайка з 141 по 143. Нарешті, у всіх випадках також було виявлено п’ять синонімічних мутацій (позначених gray ).
| Ген | Амінокислота |
|---|---|
| ORF1ab | F924F |
| D1554G | |
| S2433S | |
| L3201P | |
| D3681E | |
| N3928N | |
| L3930F | |
| P4715L | |
| A5692V | |
| С | LGV141_143del |
| E484K | |
| N501Y | |
| G593G | |
| D614G | |
| P681H | |
| S875S | |
| E1092K | |
| H1101Y | |
| V1176F | |
| ORF8 | K2Q |
| Н | R203K |
| G204R |
| Ген | Амінокислота |
|---|---|
| ORF1a | D1554G |
| S2625F | |
| D2980N | |
| L3201P | |
| D3681E | |
| L3930F | |
| ORF1b | P314L |
| L1203F | |
| A1291V | |
| С | LGV141_143del |
| E484K | |
| N501Y | |
| G593G | |
| D614G | |
| P681H | |
| S875S | |
| E1092K | |
| H1101Y | |
| V1176F | |
| ORF8 | K2Q |
| Н | R203K |
| G204R |
Історія ред.
18 лютого 2021 року Департамент охорони здоров’я Філіппін підтвердив виявлення двох мутацій COVID-19 у Центральних Вісайських островах після того, як зразки пацієнтів були відправлені для секвенування геному. Пізніше мутації були названі E484K і N501Y, які були виявлені в 37 з 50 зразків, причому обидві мутації зустрічалися одночасно в 29 з них. Офіційних назв варіантів не було, а повна послідовність ще не була визначена.
12 березня 2021 року Японія виявила цей варіант у мандрівника з Філіппін.
13 березня 2021 року Департамент охорони здоров’я підтвердив, що мутації становлять новий варіант, який був позначений як лінія P.3. Того ж дня він також підтвердив свій перший випадок лінії P.1 в країні. Хоча лінії P.1 і P.3 походять від однієї лінії B.1.1.28, у департаменті сказали, що вплив лінії P.3 на ефективність вакцини та її передачу ще не встановлено.
17 березня 2021 року Велика Британія підтвердила свої перші два випадки, коли Public Health England (PHE) назвала це VUI-21MAR-02.
30 квітня 2021 року Малайзія виявила 8 випадків походження P.3 у Сараваку.
Статистика ред.
| Країна | ЯНГОЛІН | outbreak.info | Регенерон | Інші джерела |
|---|---|---|---|---|
| Шаблон:Дані країни Philippines</img>Шаблон:Дані країни Philippines | 455 | 513 | 516 | 461 |
| США | 17 | 20 | 17 | |
| Німеччина | 11 | 11 | 11 | |
| Шаблон:Дані країни Malaysia</img>Шаблон:Дані країни Malaysia | 10 | 10 | 10 | 13 |
| Сполучене Королівство | 9 | 9 | 9 | 10 |
| Японія | 7 | 8 | 8 | |
| Нідерланди | 7 | 7 | 7 | 4 |
| Канада | 5 | 5 | 5 | |
| Австралія | 3 | 3 | 4 | |
| Бельгія | 3 | 3 | 3 | |
| Китай | 3 | 14 | 14 | |
| Гуам | 3 | – | 3 | |
| Шаблон:Дані країни New Zealand</img>Шаблон:Дані країни New Zealand | 3 | 3 | 3 | |
| Норвегія | 3 | 3 | 3 | |
| Шаблон:Дані країни Singapore</img>Шаблон:Дані країни Singapore | 3 | 3 | 3 | |
| Шаблон:Дані країни Angola</img>Шаблон:Дані країни Angola | 2 | 2 | 2 | |
| Шаблон:Дані країни South Korea</img>Шаблон:Дані країни South Korea | 2 | 2 | 2 | |
| Швеція | 2 | 2 | 2 | |
| Шаблон:Дані країни Brazil</img>Шаблон:Дані країни Brazil | 1 | 1 | 1 | |
| Фінляндія | 1 | 1 | 1 | |
| Всього | 550 | 620 | 624 | 488 |
Див. також ред.
Примітки ред.
- ↑ https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- News, Japan Times (12 березня 2021). . Архів оригіналу за 4 травня 2021. Процитовано 2 травня 2021.
- Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int (англ.). World Health Organization.
- Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int (англ.). World Health Organization.
- Variants: distribution of cases data. gov.uk. Government Digital Service.
- Tracking SARS-CoV-2 variants (англ.). 1 червня 2021. Процитовано 1 червня 2021.
- Center, Philippine Genome. PGC SARS-CoV-2 Bulletin No. 7: Detection and characterization of a new SARS-CoV-2 lineage P.3, with spike protein mutations E484K, N501Y, P681H and LGV 141–143 deletion, from samples sequenced through the intensified UP-PGC, UP-NIH and DOH biosurveillance program. Philippine Genome Center.
- ↑ P.3 Lineage Report. outbreak.info.
- News, CNN Philippines (18 лютого 2021). DOH confirms new COVID-19 mutations in Central Visayas. Процитовано 2 травня 2021.
- News, Kyodo (12 березня 2021). New coronavirus variant found in traveler from Philippines: Japan. Процитовано 2 травня 2021.
- News, ABS-CBN (13 березня 2021). DOH confirms new COVID-19 variant first detected in PH, first case of Brazil variant. Процитовано 2 травня 2021.
- News, Rappler (17 березня 2021). England reports 2 cases of new COVID-19 variant found in Philippines. Процитовано 2 травня 2021.
- Covid-19: Sarawak detects variant reported in the Philippines (англ.). 30 квітня 2021. Процитовано 30 квітня 2021.
- . cov-lineages.org. Архів оригіналу за 5 травня 2021. Процитовано 5 лютого 2022.
- Regeneron COVID-19 Dashboard. covid19dashboard.regeneron.com. Процитовано 27 серпня 2021.
- Lopez, Virgil (29 вересня 2021). DOH detects additional 339 Delta variant cases. GMA News. Процитовано 1 жовтня 2021.
- Pei Pei, Goh (8 липня 2021). Delta variant detected in Sarawak (англ.). Процитовано 13 липня 2021. «He said for the Theta variant, six cases had been detected in Kuching and seven in Kota Samarahan»
- Variants: distribution of case data, 13 August 2021 (англ.). 13 серпня 2021. Процитовано 13 серпня 2021.
- Variants in the Netherlands. rivm.nl. Процитовано 16 липня 2021.