CpG-острівець (англ. CpG island, CGI) — ділянка молекули ДНК, довжиною приблизно в 1 тис. нуклеотидів, яка містять багато послідовностей 5’-CG-3’ на одному ланцюгу ДНК. CpG послідовності у хребетних зустрічаються у вигляді скупчень, власне CpG-острівців, у місцях старту транскрипції, промоторних ділянках та міжгенних проміжках, тоді як решта геному має мало випадків послідовностей CpG.
Назва походить від скорочення «Цитозин-фосфатний залишок-Гуанін» і слугує для розмежування послідовності двох нуклеотидів поряд в одному ланцюгу від комплементарної пари C-G, де кожен нуклеотид належить окремому з двох ланцюгів ДНК.
Функціонально, CpG-острівці пов'язані з явищем метилювання ДНК по цитозину. Більша частина цитозину, до 80 % геному хребетних, метильована і лежить поза послідовністю нуклеотидів CpG, тоді як CpG-острівці здебільшого неметильовані та містять модифікацію гістонів H3K4me3 — один з маркерів еухроматину (див. табл. у (Порівняння еу- та гетерохроматину)). У той же час метилювання CpG-острівців в сайтах старту транскрипції призводить до заглушення відповідних генів на довгий час, прикладами можуть бути імпринтні гени та гени на неактивній X-хромосомі. Також характер метилювання CpG-острівців може бути тканинноспецифічним
Примітки
- Peter A. Jones (July 2012). Functions of DNA methylation: islands, start sites, gene bodies and beyond. Nature reviews. Genetics. 13 (7): 484—492. doi:10.1038/nrg3230. PMID 22641018.
- Aimee M. Deaton, Shaun Webb, Alastair R. W. Kerr, Robert S. Illingworth, Jacky Guy, Robert Andrews & Adrian Bird (July 2011). Cell type-specific DNA methylation at intragenic CpG islands in the immune system. Genome research. 21 (7): 1074—1086. doi:10.1101/gr.118703.110. PMID 21628449.
Джерела
- А. В. Сиволоб (2008). (PDF). К: Видавничо-поліграфічний центр "Київський університет". с. 193-194. Архів оригіналу (PDF) за 4 березня 2016. Процитовано 31 січня 2016.
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CpG ostrivec angl CpG island CGI dilyanka molekuli DNK dovzhinoyu priblizno v 1 tis nukleotidiv yaka mistyat bagato poslidovnostej 5 CG 3 na odnomu lancyugu DNK CpG poslidovnosti u hrebetnih zustrichayutsya u viglyadi skupchen vlasne CpG ostrivciv u miscyah startu transkripciyi promotornih dilyankah ta mizhgennih promizhkah todi yak reshta genomu maye malo vipadkiv poslidovnostej CpG CpG ostrivci v promotornij dilyanci genu de zhovtim poznacheni poslidovnosti CpG chervonim startovij kodon livoruch ta priklad standartnoyi poslidovnosti DNK bez CpG ostrivciv pravoruch CpG para na odnomu lancyugu DNK ta C G para osnov na komplementarnih lancyugah Nazva pohodit vid skorochennya Citozin fosfatnij zalishok Guanin i sluguye dlya rozmezhuvannya poslidovnosti dvoh nukleotidiv poryad v odnomu lancyugu vid komplementarnoyi pari C G de kozhen nukleotid nalezhit okremomu z dvoh lancyugiv DNK Funkcionalno CpG ostrivci pov yazani z yavishem metilyuvannya DNK po citozinu Bilsha chastina citozinu do 80 genomu hrebetnih metilovana i lezhit poza poslidovnistyu nukleotidiv CpG todi yak CpG ostrivci zdebilshogo nemetilovani ta mistyat modifikaciyu gistoniv H3K4me3 odin z markeriv euhromatinu div tabl u Porivnyannya eu ta geterohromatinu U toj zhe chas metilyuvannya CpG ostrivciv v sajtah startu transkripciyi prizvodit do zaglushennya vidpovidnih geniv na dovgij chas prikladami mozhut buti imprintni geni ta geni na neaktivnij X hromosomi Takozh harakter metilyuvannya CpG ostrivciv mozhe buti tkaninnospecifichnimPrimitkiPeter A Jones July 2012 Functions of DNA methylation islands start sites gene bodies and beyond Nature reviews Genetics 13 7 484 492 doi 10 1038 nrg3230 PMID 22641018 Aimee M Deaton Shaun Webb Alastair R W Kerr Robert S Illingworth Jacky Guy Robert Andrews amp Adrian Bird July 2011 Cell type specific DNA methylation at intragenic CpG islands in the immune system Genome research 21 7 1074 1086 doi 10 1101 gr 118703 110 PMID 21628449 DzherelaA V Sivolob 2008 PDF K Vidavnicho poligrafichnij centr Kiyivskij universitet s 193 194 Arhiv originalu PDF za 4 bereznya 2016 Procitovano 31 sichnya 2016