www.wikidata.uk-ua.nina.az
Ribozim vid angl ribozyme ribonucleic acid enzyme sho takozh nazivayetsya RNK fermentom abo katalitichnoyu RNK molekula RNK yaka volodiye katalitichnoyu aktivnistyu Bagato prirodnih ribozim katalizuyut abo gidrolizuyut odnogo iz svoyih vlasnih fosfodiesternih zv yazkiv abo gidrolizuyut fosfodiesterni zv yazki inshih molekul RNK Krim togo ribozimi vhodyat do skladu ribosom de voni katalizuyut aminotransferaznu aktivnist Shema rozrizannya RNK ribozimomDoslidniki viniknennya zhittya stvorili takozh shtuchni ribozimi zdatni katalizuvati svij vlasnij sintez podibno do RNK polimerazi hocha j u duzhe specifichnih umovah 1 Mutegenez i selekciya viyavilisya efektivnimi dlya rozvitku cih ribozim i priveli do stvorennya j izolyaciyi pokrashenih variantiv ribozim polimeraz Napriklad ribozim B6 61 zdaten dodavati do prajmeru do 20 nukleotidiv za 24 godini pislya chogo vin rujnuyetsya cherez gidroliz vlasnogo lancyuzhka 2 Taki eksperimenti stavlyatsya zdebilshogo dlya pidtverdzhennya gipotezi svitu RNK zgidno z yakoyu pershi zhivi organizmi na Zemli ne mali bilkiv i katalizuvali vsi neobhidni himichni reakciyi za dopomogoyu ribozimiv Zmist 1 Vidkrittya 2 Mehanizm 3 Ribozimi ta pohodzhennya zhittya 4 Shtuchni ribozimi 5 Vinoski 6 PosilannyaVidkrittya RedaguvatiDo vidkrittya ribozimiv fermenti yaki buli viznacheni yak katalitichni bilki 3 buli yedinimi vidomimi biologichnimi katalizatorami U 1967 r Karl Vouz Frensis Krik i Lesli Ordzhel pershimi pripustili sho RNK mozhe vistupati v roli katalizatora Cya ideya bazuvalasya na tomu sho RNK mozhe utvoryuvati skladni vtorinni strukturi 4 Ci ribozimi buli znajdeni v introni transkriptu RNK a takozh u RNK komponenti kompleksu RNKazi R yakij bere uchast u dozrivanni pre tRNK U 1989 r Tomas R Cheh i Sidni Oltmen otrimali Nobelivsku premiyu z himiyi za vidkrittya katalitichnih vlastivostej RNK 5 Termin ribozim buv vpershe vvedenij Kelli Kryugerom ta spivavtorami u 1982 r u statti opublikovanij u Cell 6 nbsp Aktivnij centr ribozimu u formi shpilkiNa pochtaku 1980 h rokiv Tomas R Cheh ta jogo kolegi z Universitetu Kolorado v Boulderi vivchav vidalennya introniv u geni ribosomnoyi RNK u infuzoriyi Tetrahymena thermophila Namagayuchis viidliti ferment vidpovidalnij za reakciyu splajsingu vin viyaviv sho okremij segment RNK yakimos chinom opinivsya viddilenij vid inshih nemov jogo virizali nozhicyami Koli vcheni pribrali vsi fermenti i inshi molekuli yaki mogli vistupati molekulyarnimi nozhicyami RNK prodovzhuvala viroblyati Tak voni znajshli pershij RNK ferment korotku dilyanku RNK yaka zdatna virizati sebe z dovgogo lancyuga chastinoyu yakoyi vona ye Priblizno v toj zhe chas Sidni Oltmen profesor Yelskogo universitetu vivchav sposib obrobki molekul tRNK u klitini koli vin ta jogo kolegi vidilili ferment pid nazvoyu RNKaza R yakij vidpovidaye za peretvorennya tRNK poperednika v aktivnu tRNK Na yihnye zdivuvannya voni viyavili sho RNKaza R krim bilka mistit RNK i sho RNK ye vazhlivim komponentom aktivnogo fermentu Nastupnogo roku Altman prodemonstruvav sho RNK mozhe diyati yak katalizator pokazavshi sho subodinicya RNKazi R mozhe katalizuvati rozsheplennya tRNK poperednika do aktivnoyi tRNK za vidsutnosti bud yakogo bilkovogo komponenta Mehanizm RedaguvatiV procesi yakij katalizuye ribozim v yakosti kofaktora bere uchast guanozin Na pershij stadiyi splajsingu vin priyednuyetsya fosoefirnim zv yazkom do 5 fosfatu pershogo nukleotidnogo zalishku introna Odnochasno vidbuvayetsya rozriv fosfodiefirnogo zv yazku mizh cim fosfatom ta 3 kincem livogo ekzona Prote livij ekzon navit ne buduchi kovalentno zv yazanim z inshoyu chastinoyu poperednika zalishayetsya poblizu ciyeyi chastini i bere uchast u drugij stadiyi yaka ye takozh reakciyeyu pereesterifikaciyi Pri comu utvoryuyetsya zv yazok mizh 3 kincem livogo ekzona ta 5 kincem pravogo V rezultati intron vidsheplyuyetsya u viglyadi pohidnoyi yaka mistit dodatkovij zalishok guanozinu na 5 kinci Drugij tip virizannya introniv buv viyavlenij pri vivchenni splajsingu mitohondrialnih pre mRNK V comu vipadku splajsing pochinayetsya z vnutrishnomolekulyarnoyi ataki 2 ON grupi odnogo z vnutrishnih zalishkiv adenozinu na 5 kincevij fosfat introna Vinikaye struktura v yakij cej vnutrishnij adenozin pov yazanij troma fosfodiefirnimi zv yazkami za uchasti vsih jogo ON grup z susidami zliva ta sprava i z kincevim fosfatom introna Pislya cogo vidbuvayetsya priyednannya ekzoniv i vidsheplennya introna u viglyadi strukturi tipu laso lariat 7 Ribozim takozh mozhe katalizuvati utvorennya peptidnogo zv yazku mizh susidnimi aminokislotami znizhuyuchi entropiyu aktivaciyi 8 Ribozimi ta pohodzhennya zhittya RedaguvatiZgidno z gipotezoyu RNK svitu na zori zarodzhennya zhittya povinni buli isnuvati ribonukleyinovi kisloti sho volodili katalitichnimi vlastivostyami tobto ribozimi i zdijsnyuvali matrichnij sintez molekul RNK 9 Odnak taki ribozimi volodiyut nedostatno visokoyu katalitichnoyu aktivnistyu na vidminu vid toyi yaka peredbachena gipotezoyu Visokoyu katalitichnoyu aktivnistyu volodiyut lishe ribozimi sho katalizuyut sintez polipeptidnih lancyugiv bilkovih molekul 10 11 Prikladom mozhe sluguvati peptidiltransferaznij centr peptidiltransferaza RTS ribosom sho yavlyaye soboyu ribozim i katalizuye proces poyednannya aminokislot u polipeptidnomu lancyuzi 12 13 Ribozimi yaki zdijsnyuyut sintez RNK z RNK polimeraznoyu aktivnistyu ye klyuchovim komponentom koncepciyi RNK svitu Bez takih ribozimiv bula b nemozhlivoyu spadkovist ta evolyuciya za Darvinom 14 U prirodi taki ribozimi praktichno ne zustrichayutsya oskilki voni buli vitisneni bilsh efektivnimi fermentami bilkovoyi prirodi polimerazami 15 Tomu dlya togo shob rekonstruyuvati pochatkovi etapi zarodzhennya zhittya i dovesti mozhlivist isnuvannya stijkogo do darvinivskoyi evolyuciyi svitu RNK vazhlivo otrimati takij ribozim u shtuchnih umovah Shtuchni ribozimi RedaguvatiVpershe shtuchnij abiogennij sintez RNK bulo prodemonstrovano u 1974 r nimeckimi vchenimi Manfredom Samperom ta Rudigerom Lyusom yaki inkubuvali sumish okremih nukleotidiv zi specifichnim virusnim fermentom Qb replikazoyu U sumishi ne mistilosya pervinnih molekul RNK Cherez deyakij promizhok chasu sposterigalosya utvorennya nevelikih oligonukleotidnih lancyuzhkiv RNK zdatnih do samopodvoyennya samoreplikaciyi 16 Shtuchno stvoreni ribozimi zdatni produkuvati neveliki oligonukleotidni lancyuzhki sho skladayutsya najchastishe z 12 14 nukleotidiv maksimalna kilkist nukleotidiv mozhe syagati 20 Priblizno cherez 24 godini pislya zavershennya sintezu vidbuvayetsya gidroliz fosfodiefirnih zv yazkiv z nastupnim rujnuvannyam lancyuzhkiv Prote najnovishi biohimichni ta cito genetichni metodi dozvolyayut vdoskonaliti katalitichnu aktivnist ribozimiv 17 Tak amerikanskimi vchenimi bulo stvoreno pokrashenij ribozim z RNK polimeraznoyu aktivnistyu zdatnij kopiyuvati molekuli RNK dovzhinoyu do 95 nukleotidiv Cej eksperiment pidtverdzhuye polozhennya koncepciyi RNK svitu oskilki tut vpershe pokazano sintez RNK bez dopomogi fermentiv bilkovoyi prirodi Vinoski Redaguvati Johnston W Unrau P Lawrence M Glasner M Bartel D 2001 RNA catalyzed RNA polymerization accurate and general RNA templated primer extension Science 292 5520 1319 25 PMID 11358999 Arhiv originalu za 27 lyutogo 2012 Procitovano 11 listopada 2007 Zaher Hani S Unrau Peter J 2007 07 Selection of an improved RNA polymerase ribozyme with superior extension and fidelity RNA New York N Y 13 7 s 1017 1026 ISSN 1355 8382 PMC 1894930 PMID 17586759 doi 10 1261 rna 548807 Procitovano 7 chervnya 2021 Definition of enzyme Dictionary com www dictionary com angl Procitovano 7 chervnya 2021 Woese Carl 1967 The genetic code the molecular basis for genetic expression New York Harper amp Row The Nobel Prize in Chemistry 1989 NobelPrize org amer Procitovano 7 chervnya 2021 Kruger Kelly Grabowski Paula J Zaug Arthur J Sands Julie Gottschling Daniel E Cech Thomas R 1 listopada 1982 Self splicing RNA Autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of tetrahymena Cell English 31 1 s 147 157 ISSN 0092 8674 PMID 6297745 doi 10 1016 0092 8674 82 90414 7 Procitovano 7 chervnya 2021 Knorre Dmitrii Georgievitz 2002 Biologitcheskaya chimiya vid 3nd rev ed Moskva Vischay schkola s 219 220 ISBN 5 06 003720 7 OCLC 641170749 Lilley David M J 27 zhovtnya 2011 Mechanisms of RNA catalysis Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences 366 1580 s 2910 2917 ISSN 0962 8436 PMC 3158914 PMID 21930582 doi 10 1098 rstb 2011 0132 Procitovano 13 chervnya 2021 Zhdankin A Ye Ushakova G O 2014 Katalitichni vlastivosti RNK klyuch do piznannya evolyucijnogo procesu oglyad Molodij vchenij 12 1 s 316 319 ISSN 2304 5809 Procitovano 13 chervnya 2021 Markov A V 2010 Rozhdenie slozhnosti evoli u t s ionnai a biologii a segodni a neozhidannye otkrytii a i novye voprosy Moskva Astrelʹ ISBN 978 5 271 24663 0 OCLC 713835517 Hartl Daniela Irmler Martin Romer Irmgard Mader Michael T Mao Lei Zabel Claus Angelis Martin Hrabe de Beckers Johannes ta in 2008 Transcriptome and proteome analysis of early embryonic mouse brain development PROTEOMICS angl 8 6 s 1257 1265 ISSN 1615 9861 doi 10 1002 pmic 200700724 Procitovano 13 chervnya 2021 rekomenduyetsya displayauthors dovidka Tang Jin Breaker Ronald R 23 travnya 2000 Structural diversity of self cleaving ribozymes Proceedings of the National Academy of Sciences angl 97 11 s 5784 5789 ISSN 0027 8424 PMID 10823936 doi 10 1073 pnas 97 11 5784 Procitovano 13 chervnya 2021 Johnston W K Unrau P J Lawrence M S Glasner M E Bartel D P 18 travnya 2001 RNA catalyzed RNA polymerization accurate and general RNA templated primer extension Science New York N Y 292 5520 s 1319 1325 ISSN 0036 8075 PMID 11358999 doi 10 1126 science 1060786 Procitovano 13 chervnya 2021 A S Spirin Ribonukleinovye kisloty kak centralnoe zveno zhivoj materii vivovoco astronet ru Procitovano 13 chervnya 2021 Walter Nils G Burke John M Millar David P 1999 06 Stability of hairpin ribozyme tertiary structure is governed by the interdomain junction Nature Structural Biology angl 6 6 s 544 549 ISSN 1545 9985 doi 10 1038 9316 Procitovano 13 chervnya 2021 Krickij M S Telegina T A 2004 Kofermenty i evolyuciya mira RNK 44 Uspehi biologicheskoj himii s 341 364 Supattapone Surachai 2004 06 Prion protein conversion in vitro Journal of Molecular Medicine Berlin Germany 82 6 s 348 356 ISSN 0946 2716 PMID 15014886 doi 10 1007 s00109 004 0534 3 Procitovano 13 chervnya 2021 Posilannya Redaguvati nbsp Ce nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title Ribozim amp oldid 39140207